结论前置：公司因员工因未涨工资辞职而扣除社保个人承担部分，一般是不合法的，但具体情况需结合劳动合同、公司规章制度及实际履行情况综合判断。以下分情况详细说明：

1. 社保个人部分的性质与承担主体

根据《社会保险法》及《工资支付暂行规定》，社保费用由用人单位和劳动者共同缴纳，其中个人承担部分（如养老保险、医疗保险、失业保险的个人缴费比例）应由用人单位从劳动者工资中代扣代缴。这一部分费用本质上是劳动者工资的组成部分，用人单位无权额外要求劳动者以现金或其他形式支付。

2. 公司扣除行为的合法性分析

• 若劳动合同或规章制度明确约定：
  若劳动合同或公司规章制度中明确规定“员工因个人原因离职时，需承担公司已为其缴纳的社保个人部分”，且该条款不违反法律强制性规定（如未低于最低工资标准、未显失公平等），则公司可能主张扣除。但此类条款在实践中易被认定为“免除用人单位法定责任、排除劳动者权利”的无效条款，尤其是当扣除导致劳动者实际收入低于最低工资标准时。

• 若劳动合同或规章制度无约定：
  公司无权单方面扣除社保个人部分。根据《劳动合同法》第三十条，用人单位应及时足额支付劳动报酬，包括代扣代缴的社保个人部分。若公司以“未涨工资”为由扣除，属于未足额支付工资，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条以“未及时足额支付劳动报酬”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金。

3. 特殊情形：公司已垫付社保个人部分

若公司因劳动者未及时办理离职手续或未配合社保减员，导致公司被迫为其多缴纳社保个人部分，公司可能主张劳动者返还。但此情形下：

• 公司需证明多缴纳的社保费用系因劳动者过错导致；
  
• 返还金额应限于公司实际垫付的部分，且不得从劳动者工资中直接扣除（需通过协商或法律途径解决）。

4. 劳动者维权建议

• 与公司协商：要求公司出具扣除依据（如劳动合同条款、规章制度），若无法提供或依据不合法，可拒绝扣除。
  
• 向劳动监察部门投诉：若公司坚持扣除，可向当地劳动保障监察大队举报，要求公司补发工资并支付经济补偿金。
  
• 申请劳动仲裁：若投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张公司支付拖欠工资、经济补偿金等。

总结：公司因员工未涨工资辞职而扣除社保个人部分，通常缺乏法律依据。劳动者应保留工资条、劳动合同等证据，通过协商、投诉或仲裁维护自身权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。