公司辞职扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 合法扣除工资的情形：

   • 法定扣除：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。例如，若员工因疏忽导致公司损失1000元，且其月工资为5000元，公司最多可扣除1000元（即20%的工资），若扣除后工资低于当地最低工资标准，则需按最低工资标准支付。
   • 约定扣除：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了某些情况下可以扣除工资，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣除工资也是合法的。比如，员工未提前通知而擅自离职，公司根据规章制度扣除部分工资作为违约金或损失赔偿，但同样需遵守上述扣除比例的限制。

2. 非法扣除工资的情形：

   • 无合法依据扣除：如果公司没有合法的理由，如员工未造成公司损失、劳动合同或规章制度中未规定扣除工资的情形等，而随意扣除员工工资，这是不合法的。例如，公司以“员工表现不佳”为由扣除工资，但并未在劳动合同或规章制度中明确规定此情形可扣除工资，且未提供员工表现不佳的具体证据，这种扣除就是非法的。
   • 超过法定比例扣除：即使公司有合法的扣除理由，但如果扣除的工资比例超过了法律规定的上限（即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%），也是不合法的。

法律建议：

• 如果公司非法扣除工资，员工有权要求公司补发被扣除的工资，并可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
• 员工在离职时，应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解自己的权益和义务，避免因为不了解规定而遭受不必要的损失。
• 如果公司提出扣除工资作为离职条件或赔偿，员工应要求公司出具书面说明，并明确扣除的金额和理由，以便在必要时维护自己的权益。

可能后果：

• 如果公司非法扣除工资，除了需要补发工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
• 对于员工来说，如果因为公司非法扣除工资而提起劳动仲裁或诉讼，且最终胜诉，公司除了需要补发工资外，还可能需要支付员工因维权而产生的合理费用，如律师费、诉讼费等。

总之，公司辞职扣工资是否合法，取决于扣除的原因和比例是否符合法律法规的规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。