针对工厂欠款，想要通过协议方案拿工厂物质进行抵押或者变卖的问题，以下是一些具体的法律分析和建议：
抵押方案：
- 签订抵押合同：首先，你可以与工厂签订一份抵押合同，明确约定工厂以其特定的物质（如设备、原材料、产品等）作为债务的抵押物。合同中应详细列明抵押物的名称、数量、质量、价值、抵押期限以及抵押权的实现方式等关键条款。
- 办理抵押登记：根据《民法典》的相关规定，以动产抵押的，抵押权自抵押合同生效时设立；但是，未经登记，不得对抗善意第三人。因此，为了确保你的抵押权具有更强的法律效力，建议到相关登记机构办理抵押登记手续。
- 抵押权的实现：在工厂未能按期履行债务的情况下，你可以依据抵押合同的约定和法律规定，通过拍卖、变卖抵押物的方式优先受偿。
变卖方案（需工厂同意或法律程序）：
- 协商变卖：如果工厂同意，你可以与工厂协商一致，将抵押物或工厂的其他物质进行变卖，以所得价款清偿债务。这种方式需要工厂的积极配合，且应签订书面协议明确双方的权利义务。
- 申请法院拍卖、变卖：如果工厂不同意变卖或无法就变卖事宜达成一致，你可以在提起诉讼或申请仲裁后，向法院申请强制执行。在执行过程中，法院可以依法对工厂的财产进行查封、扣押、拍卖或变卖，以所得价款清偿你的债权。但需要注意的是，这一过程需要遵循严格的法律程序，且可能涉及一定的时间和成本。
法律建议与注意事项：
- 确保协议合法有效：无论是抵押合同还是变卖协议，都应确保内容合法、条款清晰、双方意思表示真实，以避免因协议无效或存在瑕疵而引发纠纷。
- 及时办理相关手续：如抵押登记等，以确保你的权益得到法律的有效保护。
- 考虑工厂的实际情况：在制定协议方案时，应充分考虑工厂的财务状况、经营能力等因素，以确保协议的可行性和有效性。
- 寻求专业法律帮助：由于涉及复杂的法律关系和程序，建议你在制定和执行协议方案过程中寻求专业律师的帮助，以确保你的权益得到充分保障。
可能面临的法律后果：
- 如果抵押合同或变卖协议存在瑕疵或无效情形，可能导致你的权益无法得到充分保障。
- 如果未经工厂同意或未遵循法律程序擅自变卖工厂物质，可能构成侵权或违法行为，需要承担相应的法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。