事业单位员工合同到期，不再续签是合法的，但需遵循一定的法律程序和规定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条第一项规定，劳动合同期满的，劳动合同终止。同时，《事业单位人事管理条例》也规定了事业单位与工作人员订立的聘用合同期限一般不低于3年，以及合同终止的相关情形。因此，从法律层面讲，事业单位在合同期满后选择不再续签是合法的。
二、处理流程与注意事项
提前通知：
- 事业单位应在合同期满前一定时间内（如30日）书面通知劳动者是否续签合同。若决定不续签，应明确告知劳动者，并说明理由。这是保障劳动者知情权的重要步骤。
工作交接：
- 合同期满后，劳动者应按照单位要求办理工作交接手续，包括归还办公用品、资料等，确保工作的连续性和稳定性。这是劳动者应尽的义务。
经济补偿：
- 根据《劳动合同法》规定，除用人单位维持或提高劳动合同约定条件续订劳动合同而劳动者不同意续订的情形外，用人单位终止固定期限劳动合同的，应向劳动者支付经济补偿。
- 经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这是保障劳动者权益的重要措施。
出具证明：
- 用人单位应在解除或终止劳动合同时出具相关证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这是用人单位的法定义务。
争议解决：
- 若因合同期满不续签产生争议，双方可协商解决；协商不成的，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁结果不服的，还可向人民法院提起诉讼。这是解决劳动争议的法定途径。
三、特殊情形处理
无固定期限劳动合同：
- 若劳动者在事业单位连续工作满十年且距法定退休年龄不足十年，或连续订立二次固定期限劳动合同且没有法定不续签情形的，劳动者提出续订无固定期限劳动合同的，事业单位应当与其订立。这是保护劳动者长期就业权益的规定。
孕期、产期、哺乳期女职工：
- 对于处于孕期、产期、哺乳期的女职工，即使合同期满，用人单位也不得随意解除劳动合同，而应顺延至相应情形消失时终止。这是保护女职工特殊权益的规定。
四、建议与提醒
- 保留证据：在整个处理过程中，事业单位和劳动者都应保留好相关证据，如通知书、交接清单、工资条等，以备不时之需。
- 沟通协商：双方应保持积极沟通，尽量通过协商解决问题，避免不必要的法律纠纷。
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