结论：若解除劳动合同协议中写着工资已结清，但实际工资低于最低标准，劳动者仍有权要求用人单位补足差额，并可考虑通过法律途径维护自身权益。
分析说明：
最低工资标准的法律意义：
- 最低工资标准是法律规定的，用人单位支付给劳动者的最低劳动报酬，旨在保障劳动者的基本生活需求。
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
工资结清条款的效力：
- 解除劳动合同协议中的“工资已结清”条款，若实际工资低于最低标准，该条款可能因违反法律强制性规定而部分无效。
- 劳动者有权要求用人单位按照最低工资标准补足差额，因为这一要求符合法律对劳动者基本权益的保护。
劳动者的维权途径：
- 协商：劳动者可以首先尝试与用人单位协商，要求补足工资差额。
- 投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
- 仲裁或诉讼：劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼，要求用人单位支付工资差额及可能的赔偿金。
特殊场景：
- 用人单位抗辩：若用人单位主张已按照协议支付工资，且劳动者在签署协议时已知悉并同意工资标准，用人单位可能试图以此抗辩。但如劳动者能证明实际工资低于最低标准，且该标准未在协议中明确体现或劳动者签署时存在误解，劳动者的诉求仍可能得到支持。
- 证据收集：劳动者在维权过程中，应尽可能收集相关证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同、解除劳动合同协议等，以证明实际工资低于最低标准的事实。
行动建议：
- 保留证据：劳动者应妥善保管与工资支付相关的所有证据，以备不时之需。
- 及时咨询：如有需要，劳动者可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。
- 积极维权：劳动者应积极维护自己的合法权益，不要因用人单位的强势或威胁而放弃维权。
法律后果：
- 若用人单位未按照最低工资标准支付工资，劳动行政部门将责令其限期支付；逾期不支付的，将责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
- 劳动者因此解除劳动合同的，用人单位还需支付经济补偿金。