针对您提出的“有法人证的员工离职怎么办”这一问题，这确实是一个涉及公司治理和员工权益的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，员工在职期间根据公司安排担任法定代表人，这一身份在员工离职后应当得到妥善的处理。法定代表人作为公司的“代言人”，其权责利应相一致，且其选举、变更通常属于公司内部治理范畴。然而，当员工离职后，若公司未及时办理法定代表人的变更登记，就可能导致员工面临“人去身份在”的尴尬处境，甚至可能因公司经营问题而承担不必要的风险。

针对这种情况，员工可以采取以下步骤来维护自己的权益：

1. 与公司沟通：

   • 员工在离职后，应首先与公司进行沟通，明确表达自己希望涤除法定代表人身份的意愿，并要求公司及时办理工商变更登记。

2. 保留证据：

   • 在沟通过程中，员工应保留好与公司沟通的记录，如邮件、短信、聊天记录等，以证明自己已经明确表达了辞职意思表示，并要求公司办理变更登记。

3. 穷尽内部救济途径：

   • 若公司拒绝办理变更登记，员工应尝试通过公司内部的其他救济途径来解决问题，如向股东会、董事会等有权机构提出申请，要求其作出变更法定代表人的决议。

4. 寻求司法救济：

   • 若公司内部救济途径无法解决问题，员工有权向法院提起诉讼，请求法院判决公司办理法定代表人的变更登记。在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据来证明自己已经离职，且不再参与公司的经营管理，同时证明涤除法定代表人身份的请求具有正当性和合理性。

5. 关注公司自治与司法介入的平衡：

   • 需要注意的是，公司治理应以公司自治为主，但当公司自治出现问题时，司法的合理介入可以在一定程度上提示、防范、避免、化解公司内部治理的法律风险。因此，在员工穷尽内部救济途径后仍未能涤除登记的情况下，通过司法途径寻求救济是合理的选择。

6. 预防措施：

   • 对于未来可能担任法定代表人的员工，建议在接受这一职务前，认真了解法律及公司章程规定的权利义务，并在离职时向公司及股东会等有权机构明确作出辞职意思表示，并保留相应证据，以降低潜在风险。

综上所述，有法人证的员工在离职后，若公司未及时办理法定代表人的变更登记，员工可以通过与公司沟通、保留证据、穷尽内部救济途径、寻求司法救济等步骤来维护自己的权益。同时，也建议公司在员工离职后及时办理工商变更登记，以保障公司有序平稳经营。