结论前置：员工提出辞职不满30天又撤回，公司不同意的情况下，公司的做法是否合法，需根据具体情况来判断，主要取决于撤回辞职的时机以及公司的相关规章制度。以下从不同角度进行分析：
一、撤回辞职的时机
在辞职通知到达公司前撤回：
- 如果员工在发出辞职通知后，但在该通知实际到达公司之前撤回，且公司尚未收到该通知，那么从法律上讲，辞职行为尚未生效。此时，员工撤回辞职的意愿应当被视为有效，公司不同意撤回的做法可能缺乏法律依据。但这种情况在实际操作中较为少见，因为员工通常难以控制通知的传递过程。
在辞职通知到达公司后，但未满30天前撤回：
- 一旦辞职通知到达公司，且公司已明确知晓员工的辞职意愿，员工再想撤回辞职就变得复杂了。根据《劳动合同法》的相关规定，员工提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这里的“30日”是一个法定的预告期，旨在给公司足够的时间来安排工作交接和寻找替代人员。
- 若公司规章制度或劳动合同中未明确规定撤回辞职的程序和条件：在这种情况下，员工撤回辞职的意愿可能无法直接产生法律效力，因为公司有权依据法律规定和内部规章制度来处理员工的辞职申请。如果公司不同意撤回，且员工无法提供充分理由（如因重大误解、欺诈、胁迫等情形而提出辞职），则公司的做法可能被视为合法。
- 若公司规章制度或劳动合同中明确规定了撤回辞职的程序和条件：例如，规定员工在提出辞职后的一定期限内（如3日内）可以书面形式撤回辞职申请，且公司同意撤回的，则员工有权撤回辞职。在这种情况下，如果公司不同意撤回，且员工已按照规章制度或劳动合同的规定行使了撤回权，则公司的做法可能构成违法。
二、公司的相关规章制度
- 公司的规章制度在处理员工辞职和撤回辞职的问题上起着至关重要的作用。如果公司的规章制度明确规定了员工辞职和撤回辞职的程序和条件，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权依据这些规定来处理员工的辞职申请和撤回申请。
- 如果公司的规章制度存在模糊不清或违反法律法规的情形，那么在处理员工辞职和撤回辞职的问题时，公司可能会面临法律风险。例如，如果规章制度中未规定撤回辞职的程序和条件，但公司却擅自拒绝员工的撤回申请，且员工能够证明其撤回辞职的意愿是合理且合法的，那么公司可能会因此承担法律责任。
三、法律建议
- 对于员工而言：在提出辞职前应慎重考虑，确保自己的决定是经过深思熟虑的。如果确实需要撤回辞职申请，应尽快与公司沟通，并了解公司的相关规章制度和劳动合同中的相关规定。如果公司不同意撤回，且员工认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁。
- 对于公司而言：应制定明确、合理的规章制度来规范员工的辞职和撤回辞职行为。在处理员工的辞职申请和撤回申请时，应遵循法律法规的规定和公司的规章制度，确保处理过程的合法性和公正性。如果公司不同意员工的撤回申请，应向员工说明理由，并保留相关证据以应对可能的法律纠纷。
总结来说，员工提出辞职不满30天又撤回，公司不同意的情况下，公司的做法是否合法需根据具体情况来判断。如果员工能够证明其撤回辞职的意愿是合理且合法的，且公司的规章制度或劳动合同中未明确规定拒绝撤回的情形，那么公司的做法可能构成违法。因此，在处理此类问题时，建议双方都应遵循法律法规的规定和公司的规章制度，通过沟通协商来解决问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。