药店老板体罚员工，员工可以向劳动监察部门投诉，也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，若构成犯罪的，还可以向公安机关报案。以下是具体分析：

1. 向劳动监察部门投诉
   根据《劳动保障监察条例》的规定，劳动监察部门有权对用人单位遵守劳动保障法律、法规的情况进行监督检查，对违反劳动保障法律、法规的行为有权制止，并责令改正。体罚员工属于违反劳动保障法律、法规的行为，因此，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，要求其对药店老板的违法行为进行调查处理。

2. 向劳动争议仲裁委员会申请仲裁
   如果药店老板的体罚行为给员工造成了身体或精神上的损害，员工还可以依据《劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求药店老板承担相应的赔偿责任。在申请仲裁时，员工需要提供相关证据证明药店老板存在体罚行为，以及该行为给自己造成了损害。

3. 向公安机关报案
   如果药店老板的体罚行为情节严重，构成犯罪的（如故意伤害罪等），员工还可以向公安机关报案，要求追究药店老板的刑事责任。公安机关在接到报案后，会依法进行调查处理，并根据调查结果决定是否立案侦查。

在处理此类纠纷时，员工应注意保留相关证据，如体罚现场的录音录像、医疗记录、证人证言等，以便在后续的投诉、仲裁或诉讼中证明自己的主张。如果还有其他疑问，欢迎直接向我咨询。