关于公司开设柜台债券是否违法及处理方式的问题，需要分情况讨论：
一、合法开设柜台债券的情况
符合监管要求：
- 如果公司开设的柜台债券业务完全符合国家金融监管机构（如中国证券监督管理委员会、中国人民银行等）的相关规定，包括但不限于债券的发行、交易、信息披露、投资者适当性管理等环节，那么这种行为是合法的。
- 例如，公司作为债券承销商或交易商，在获得相关监管批准后，可以在其营业场所或通过电子平台提供债券的买卖服务。
内部合规管理：
- 公司内部应建立完善的合规管理制度，确保柜台债券业务的开展符合法律法规和监管要求，包括但不限于客户身份识别、反洗钱、风险控制等方面。
二、违法开设柜台债券的情况及处理方式
未经批准擅自开展：
- 违法性：如果公司未经金融监管机构批准，擅自开设柜台债券业务，进行债券的买卖或提供相关服务，这构成非法金融活动，违反了《中华人民共和国证券法》、《中华人民共和国中国人民银行法》等相关法律法规。
- 处理方式：
- 监管机构可能会对公司进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。
- 如果情节严重，构成犯罪的，公司及其相关责任人员可能会被追究刑事责任，如非法经营罪等。
违反信息披露和投资者保护规定：
- 违法性：在柜台债券业务中，如果公司未按照规定进行信息披露，或者未对投资者进行适当性管理，导致投资者权益受损，这也构成违法行为。
- 处理方式：
- 监管机构可能会对公司进行行政处罚，并要求公司承担民事赔偿责任，赔偿投资者的损失。
- 如果公司存在故意隐瞒重要信息或欺诈投资者的行为，还可能构成犯罪，如欺诈发行证券罪等。
内幕交易和操纵市场：
- 违法性：在柜台债券业务中，如果公司或其员工利用内幕信息进行交易，或者操纵市场价格，这也构成严重的违法行为。
- 处理方式：
- 监管机构会对公司进行严厉的行政处罚，并可能吊销其相关业务资格。
- 相关责任人员可能会被追究刑事责任，如内幕交易罪、操纵证券市场罪等。
三、建议与措施
加强合规管理：
- 公司应建立健全的合规管理制度，确保柜台债券业务的开展符合法律法规和监管要求。
- 定期对员工进行合规培训，提高员工的合规意识和风险意识。
及时咨询与报备：
- 在开展柜台债券业务前，公司应咨询相关监管机构，了解业务开展的合规要求和流程。
- 按照监管要求及时报备业务开展情况，接受监管机构的监督和检查。
积极应对监管调查：
- 如果公司收到监管机构的调查通知或行政处罚决定书，应积极配合调查，如实提供相关资料和信息。
- 如有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护公司的合法权益。
如果您对公司开设柜台债券业务有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。