结论：在工伤认定中，若老板有不在现场的证据，且不确定员工是否在厂里受伤，甚至怀疑员工自残，这些情况都会对工伤认定产生影响，但并不意味着员工就一定不能被认定为工伤。具体能否认定为工伤，需根据实际情况，结合相关法律法规进行综合判断。以下从几个方面进行详细分析：

一、工伤认定的基本原则

根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定主要遵循“三工”原则，即工作时间、工作场所、因工作原因。若员工受伤符合这三个条件，一般应认定为工伤。然而，在实际操作中，情况往往更为复杂，需要综合考虑多种因素。

二、老板不在现场的影响

老板不在现场，并不直接决定员工是否构成工伤。工伤认定的关键在于员工受伤是否发生在工作时间、工作场所，且是否因工作原因。若员工能提供充分证据证明其受伤符合这些条件，即使老板不在现场，也不影响工伤的认定。

三、不确定是否在厂里受伤的情况

若不确定员工是否在厂里受伤，这将对工伤认定构成一定障碍。因为工作场所是工伤认定的关键要素之一。若无法确定受伤地点，则难以直接适用“三工”原则。此时，需进一步调查取证，如查看监控录像、询问目击者等，以确定员工受伤的具体地点和原因。

四、怀疑员工自残的情况

若老板怀疑员工自残，这将对工伤认定产生重大影响。根据《工伤保险条例》的规定，自残或者自杀的，不得认定为工伤或者视同工伤。因此，若老板能提供充分证据证明员工是自残，则员工将无法被认定为工伤。然而，若老板仅是怀疑而无确凿证据，则不能仅凭怀疑就否定员工的工伤认定申请。

五、具体建议

1. 收集证据：无论是员工还是老板，都应积极收集与受伤事件相关的证据，如监控录像、目击者证言、医疗记录等。这些证据将有助于更准确地判断员工受伤的原因和地点。
2. 申请工伤认定：员工应在受伤后及时向用人单位提出工伤认定申请，并提交相关证据。若用人单位未在规定时间内提出申请，员工或其近亲属也可以直接向社会保险行政部门提出申请。
3. 寻求法律援助：若在工伤认定过程中遇到争议或困难，建议及时寻求专业律师的法律援助。律师将能够提供专业的法律意见和帮助，维护当事人的合法权益。

举例说明：假设某员工在工作时间内在厂区内受伤，但老板因外出开会而不在现场。此时，若员工能提供监控录像等证据证明其受伤是在工作过程中发生的，且非自残行为，则该员工应被认定为工伤。反之，若老板能提供证据证明员工是自残或受伤地点不在工作场所内，则该员工可能无法被认定为工伤。

后续行动建议：若您或您身边的人遇到类似情况，建议首先收集相关证据，然后及时向用人单位或社会保险行政部门提出工伤认定申请。如有需要，也可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。