员工只是虚开发票，一般会被认定为虚开发票罪，而非骗取出口退税罪的从犯，但具体还需根据虚开发票的种类和目的等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、罪名认定的一般原则

1. 虚开发票罪：根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一的规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票以外的其他发票（如普通发票），情节严重的，构成虚开发票罪。这一罪名主要针对的是虚开非特定用途发票的行为。

2. 骗取出口退税罪的从犯：骗取出口退税罪是指以假报出口或者其他欺骗手段，骗取国家出口退税款的行为。如果员工虚开的发票是用于骗取出口退税的，且其行为在骗取出口退税的犯罪中起到了辅助作用，那么该员工可能被认定为骗取出口退税罪的从犯。然而，这要求员工明知发票将用于骗取出口退税，并积极参与或协助了骗取行为。

二、具体情形分析

1. 虚开普通发票：如果员工虚开的是普通发票，且没有证据表明这些发票被用于骗取出口退税或其他非法目的，那么该员工一般只构成虚开发票罪。

2. 虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票：

   • 若未用于骗取出口退税：即使员工虚开的是增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，但如果没有证据表明这些发票被实际用于骗取出口退税或抵扣税款，那么该员工仍然只构成虚开发票罪（针对增值税专用发票的虚开，可能构成更严重的虚开增值税专用发票罪，但并非骗取出口退税罪的从犯）。
   • 若用于骗取出口退税：如果员工虚开的发票被明确用于骗取出口退税，且其明知这一点并积极参与或协助了骗取行为，那么该员工可能构成骗取出口退税罪的从犯。但这种情况需要充分的证据来证明员工的明知和参与程度。

三、法律建议

1. 对于员工而言：应严格遵守法律法规，不得虚开发票或参与任何形式的骗税行为。如果发现自己被卷入此类犯罪活动，应立即向公安机关报案并配合调查。

2. 对于企业而言：应加强内部管理，建立健全的发票管理制度和内部控制机制，防止员工虚开发票或参与骗税行为。同时，企业也应定期对员工进行法律培训，提高员工的法律意识和合规意识。

3. 在面临法律纠纷时：如果员工或企业因虚开发票或骗取出口退税等问题面临法律纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决方案。

如有任何进一步的问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。