结论概述：员工在不知公司骗税的情况下虚开发票，其是否会被起诉及以何种罪名被起诉，需根据具体情况判断。若员工确实不知情且未参与骗税活动，一般不构成骗取出口退税罪或虚开增值税专用发票罪的共犯；但若员工存在过错或故意，则可能面临相应的刑事责任。以下是对此问题的详细分析：
一、不知情且未参与骗税活动的情况
不构成骗取出口退税罪或虚开增值税专用发票罪的共犯：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，骗取出口退税罪和虚开增值税专用发票罪均要求行为人具有故意的主观心态，即明知自己的行为会发生危害社会的结果，并且希望或者放任这种结果发生。
- 若员工确实不知公司是在骗税，且未参与骗税活动的策划、实施等环节，那么员工在主观上缺乏故意，因此不构成上述两罪的共犯。
可能面临的法律后果：
- 在这种情况下，员工一般不会因虚开发票行为而被起诉。但需要注意的是，如果员工虚开的发票被用于骗税，且员工在虚开发票过程中存在过错（如未尽到合理的审查义务），虽然不构成犯罪，但可能面临行政处罚或民事赔偿责任。
二、存在过错或故意的情况
构成共同犯罪的可能性：
- 如果员工虽然不知公司具体骗税计划，但明知公司存在骗税的嫌疑或风险，仍然虚开发票，或者为了谋取私利而故意虚开发票，那么员工在主观上可能具有间接故意或直接故意，有可能构成骗取出口退税罪或虚开增值税专用发票罪的共犯。
- 在这种情况下，员工将根据其在共同犯罪中的作用和地位，承担相应的刑事责任。
具体罪名的确定：
- 如果员工被认定为共同犯罪中的一员，其罪名将根据具体案情和法律规定来确定。例如，如果员工主要参与虚开发票行为，且该行为是骗税活动的重要组成部分，那么员工可能以虚开增值税专用发票罪被起诉。
- 如果员工不仅参与虚开发票，还积极参与骗税活动的其他环节（如提供虚假资料、协助资金流转等），那么员工可能以骗取出口退税罪被起诉。
三、法律建议
对于员工而言：
- 在工作中应严格遵守法律法规，不得虚开发票或参与任何违法活动。
- 如果发现公司存在骗税等违法行为，应及时向相关部门举报，以维护自身合法权益和社会公共利益。
对于公司而言：
- 应建立健全的财务管理制度，加强内部监督和管理，防止员工虚开发票或参与骗税活动。
- 如果发现员工存在违法行为，应及时采取措施予以纠正，并依法追究相关责任人的法律责任。
四、后续行动建议
- 如果您或您身边的人遇到类似情况，建议立即收集相关证据（如工作记录、聊天记录、邮件等），以便在需要时证明自己的清白或追究相关责任人的法律责任。
- 有问题可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。