挂靠公司赔了钱，处理方式需根据挂靠协议的具体约定及实际法律关系分情况讨论：

1. 若挂靠协议明确约定了亏损承担方式
   根据《民法典》第465条，依法成立的合同对当事人具有法律约束力。若协议中明确约定“挂靠方自行承担经营亏损”或“被挂靠方仅收取固定管理费不参与利润分配及亏损承担”，则亏损原则上应由挂靠方自行承担。此时需注意：

   • 协议是否存在无效情形（如违反法律强制性规定、恶意串通损害第三方利益等）；
     
   • 被挂靠方是否实际履行了协议义务（如提供资质、协助办理手续等），若未履行可能需承担部分责任。

2. 若挂靠协议未约定或约定不明
   根据《民法典》第510条，可按以下原则处理：

   • 内部关系：挂靠方与被挂靠方之间可能构成合伙关系（共同经营、共享收益、共担风险），此时亏损通常按出资比例或约定比例分担；
     
   • 外部关系：若第三方因挂靠行为受损（如供应商货款、员工工资等），被挂靠方作为名义经营者可能需先承担责任，再向挂靠方追偿（《民法典》第1七十二条）。

3. 若挂靠行为被认定为违法
   根据《建筑法》第26条、《道路运输条例》第33条等规定，挂靠经营可能因违反行政许可规定而被认定无效。此时：

   • 行政机关可能对双方处以罚款、没收违法所得等处罚；
     
   • 亏损承担需结合双方过错程度分配（如被挂靠方明知违法仍提供资质，可能承担主要责任）。

行动建议：

• 立即梳理挂靠协议、财务凭证、沟通记录等证据；
  
• 评估亏损金额、涉及第三方权益情况及协议履行细节；
  
• 根据具体场景选择协商、调解或诉讼途径解决，必要时可委托律师介入谈判或起草法律文件。
  

如有进一步细节需要分析，可直接向我咨询。