结论：在合同纠纷中，是否可以请求法院判决补延承包期限代替违约损失赔偿，需根据具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：
一、合同约定与法律规定
合同约定优先：
- 如果承包合同中明确约定了违约责任为补延承包期限，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么根据合同自由原则，当事人可以依据合同约定请求法院判决补延承包期限。
法律规定补充：
- 若合同未约定或约定不明确，根据《民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。在此情况下，补延承包期限若能视为一种继续履行或补救措施，且不损害对方合法权益，法院可能会根据具体情况予以支持。但若补延承包期限无法实现合同目的或造成对方不合理负担，法院则可能不支持此请求，而判决赔偿损失。
二、补延承包期限的合理性
合同目的实现：
- 补延承包期限是否合理，首先要看其是否能实现合同目的。如果补延后，合同能够继续履行且达到原合同预期的效果，那么补延承包期限可能是一个合理的解决方案。
对方利益考量：
- 补延承包期限还需考虑对方的利益。如果补延会对对方造成不合理的不便或损失，如对方已基于原合同期限进行了其他安排或投资，那么补延可能不被法院支持。
三、违约损失赔偿的替代性
损失赔偿的充分性：
- 如果违约造成的损失能够通过金钱赔偿得到充分补偿，且补延承包期限并非必要或合理，那么法院可能更倾向于判决赔偿损失，而非补延承包期限。
当事人选择权：
- 在某些情况下，当事人可能更倾向于获得金钱赔偿，以便更灵活地处理后续事宜。此时，即使补延承包期限在法律上可行，法院也可能尊重当事人的选择，判决赔偿损失。
四、实际操作建议
协商优先：
- 在发生合同纠纷时，建议双方首先尝试通过协商解决。协商过程中，可以就补延承包期限或赔偿损失等方案进行充分讨论，以达成双方都能接受的解决方案。
法律途径：
- 若协商无果，当事人可以依法向法院提起诉讼。在诉讼过程中，应充分准备证据，证明自己的主张合理合法。同时，也要尊重法院的判决，履行相应的义务。
总结：是否可以请求法院判决补延承包期限代替违约损失赔偿，需根据合同约定、法律规定、补延的合理性以及违约损失赔偿的替代性等多方面因素进行综合考量。在实际操作中，建议当事人优先通过协商解决纠纷，若协商无果，则依法向法院提起诉讼，并充分准备证据以支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。