在民事代位诉讼中，若原告难以对被告与第三人之间的债权债务进行举证，可以采取以下措施来应对：

1. 利用法律规定的举证责任分配原则：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，在民事诉讼中，一般遵循“谁主张，谁举证”的原则。但在代位诉讼这种特殊情形下，若原告因客观原因无法直接获取被告与第三人之间的债权债务证据，可以积极向法院说明情况，请求法院依据职权调查取证，或者依据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》中关于举证责任转移的规定，尝试将部分举证责任转移至被告或第三人，尤其是在被告或第三人持有相关证据却拒不提供的情况下。

2. 申请法院调查取证：

   • 原告可以向法院提交书面申请，请求法院对被告与第三人之间的债权债务关系进行调查。这包括但不限于查询银行转账记录、合同文件、往来函件等可能证明债权债务关系的证据。法院在审查申请后，若认为有必要，会依法进行调查取证。

3. 借助第三方机构或专家辅助：

   • 在某些复杂或专业的债权债务关系中，原告可以考虑聘请会计师事务所、审计机构或相关领域的专家对被告与第三人之间的交易进行审计或评估，以获取更专业、更客观的证据。这些第三方机构或专家出具的报告或意见，往往能作为有力的证据提交给法院。

4. 利用证据保全措施：

   • 若原告担心被告或第三人在诉讼过程中可能毁灭、隐匿或转移相关证据，可以及时向法院申请证据保全。证据保全措施可以确保在诉讼过程中，相关证据得以完整保存，为原告的举证提供有力支持。

5. 积极收集间接证据形成证据链：

   • 尽管直接证据难以获取，但原告仍可以积极收集与被告与第三人之间债权债务关系相关的间接证据，如聊天记录、邮件往来、证人证言等。这些间接证据虽然单独看可能不足以证明债权债务关系，但当它们形成完整的证据链时，往往能起到关键的证明作用。

6. 考虑与被告或第三人进行和解或调解：

   • 在诉讼过程中，若原告发现直接举证确实困难，且诉讼成本较高，可以考虑与被告或第三人进行和解或调解。通过协商达成一致意见，既可以节省诉讼成本，又能快速解决纠纷。当然，这需要原告在权衡利弊后做出明智的选择。

在采取上述措施时，原告还需注意以下几点：

• 及时行动：在发现举证困难时，应尽快采取措施，避免证据灭失或难以获取。
• 合法合规：在收集证据和申请法院调查取证时，必须遵守法律法规，不得侵犯他人合法权益。
• 充分准备：在诉讼过程中，应充分准备相关材料，包括证据清单、法律意见书等，以便在法庭上充分展示自己的观点和证据。

若原告在代位诉讼中确实无法获取足够证据来证明被告与第三人之间的债权债务关系，且法院最终未能支持其诉讼请求，原告可能需要承担败诉的风险。因此，在提起代位诉讼前，原告应充分评估举证难度和诉讼风险，谨慎决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。