结论：在合同中约定每日千分之五的违约金，从法律角度是允许的，但该约定可能因过高而被法院或仲裁机构调整，且需考虑实际损失情况。

详细分析：

1. 法律允许性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。因此，在合同中约定每日千分之五的违约金，从法律条文的角度来看，是允许的。

2. 违约金调整的可能性：

   • 虽然法律允许当事人约定违约金，但《民法典》也规定，约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。这意味着，如果每日千分之五的违约金被认为过高，超出了实际损失的合理范围，那么法院或仲裁机构有权对其进行调整。

3. 实际损失的考量：

   • 在判断违约金是否过高时，法院或仲裁机构会考虑实际损失情况。如果50万工钱的拖欠导致的实际损失远低于每日千分之五的违约金计算出的金额，那么该违约金约定很可能被视为过高，并面临被调整的风险。

4. 建议：

   • 在约定违约金时，建议双方充分考虑实际损失情况，并合理设定违约金数额。如果希望确保违约金的合理性并减少被调整的风险，可以事先咨询专业律师，对违约金数额进行合理评估和设定。
   • 另外，如果担心违约金可能不足以覆盖实际损失，还可以考虑在合同中约定其他赔偿方式，如赔偿实际损失、支付利息等，以更全面地保障自身权益。

示例说明： 假设因拖欠50万工钱导致的实际损失为每日千分之一（即每日500元），而合同中约定的违约金为每日千分之五（即每日2500元）。在这种情况下，如果违约方提出违约金过高的抗辩，法院或仲裁机构很可能会根据实际损失情况对违约金进行调整，降低至每日千分之一或更低的合理水平。

后续行动建议： 如果您在合同中约定了每日千分之五的违约金，并担心其可能过高或面临被调整的风险，或者您希望更全面地了解违约金约定的法律后果和风险，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。