在处理挂靠关系中的工程材料款纠纷时，我们需要综合考虑多个法律层面和实际操作步骤，以确保纠纷得到妥善解决。以下是一个详细且具有深度的解答：
一、明确挂靠关系的法律效力与后果
首先，需要明确的是，挂靠行为在法律上是被禁止的。根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，无资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订的建设工程施工合同是无效的。这种无效性不仅影响合同的直接效力，还可能对工程款结算、责任划分等后续问题产生深远影响。
二、工程款结算问题
工程验收合格的情况：
- 尽管合同无效，但如果工程已经通过竣工验收且质量合格，实际施工人（即挂靠方）仍有权参照合同中的约定请求支付工程价款。法院在审理此类案件时，通常会尊重合同中关于工程款计价方式和支付条件的约定进行结算。
工程验收不合格的情况：
- 如果工程质量不合格，且无法修复或修复后仍不合格，那么实际施工人将无权请求支付工程价款。此外，实际施工人还需对因工程质量问题给发包人造成的损失承担赔偿责任。
三、责任划分
在挂靠关系中，责任划分是一个关键问题。通常，挂靠方和被挂靠方都需要承担一定的责任：
挂靠方责任：
- 挂靠方作为实际施工人，对工程质量、安全等负有直接责任。如果因工程质量问题或施工安全事故给发包人或第三方造成损失，挂靠方需承担主要赔偿责任。
被挂靠方责任：
- 被挂靠方因允许他人挂靠其资质而存在过错，通常需对挂靠方在工程施工中的行为承担连带责任。这包括工程款支付和工程质量问题导致的赔偿责任。
四、纠纷解决途径
在处理挂靠关系中的工程材料款纠纷时，可以选择以下几种途径：
协商解决：
- 首选方式是通过友好协商寻求一致解决方案。各方可以重新核对工程量、单价等，以确定工程款数额，并尝试达成和解协议。
调解：
- 如果协商不成，可以请求第三方（如行业协会、建设工程管理部门）进行调解。调解过程相对灵活，有助于促成双方和解。
仲裁或诉讼：
- 如果合同中有仲裁条款，任何一方可以将争议提交约定的仲裁机构进行仲裁。仲裁裁决具有终局性和约束力。
- 如果没有仲裁协议，则可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要遵循法律程序，提交充分证据，并积极参与庭审。
五、具体操作建议
收集证据：
- 全面收集与纠纷相关的证据，包括挂靠合同、施工过程中的通知、函件、会议纪要、财务凭证（如工程款支付记录）、验收文件等。这些证据将有助于证明你的主张和权益。
确定诉讼主体：
- 根据具体情况确定原告和被告。通常，权益受损方（如挂靠方或被挂靠方）可以作为原告提起诉讼，而相对方则作为被告。如果涉及多方责任，如转包、违法分包等，可能需要列共同被告或第三人。
撰写起诉状：
- 规范撰写起诉状，详细列明原、被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由以及证据清单。确保起诉状内容准确无误，逻辑清晰。
委托专业律师：
- 鉴于法律程序的复杂性和专业性，建议委托经验丰富的律师代理诉讼。律师可以提供专业的法律意见和策略建议，帮助你更好地维护自身合法权益。
综上所述，处理挂靠关系中的工程材料款纠纷需要综合考虑多个方面，包括合同效力、工程款结算、责任划分以及纠纷解决途径等。通过明确法律后果、收集充分证据、确定诉讼主体、撰写规范起诉状以及委托专业律师等步骤，你可以更有效地维护自己的合法权益。