在处理建筑工程合同纠纷中的挂靠问题时，我们需要综合考虑多个方面，包括合同效力、纠纷解决途径以及法律责任承担等。以下是对这一问题的详细分析和建议：
一、明确挂靠关系与合同效力
首先，要依据相关事实和证据确定是否存在挂靠关系。通常，若实际施工人（挂靠人）借用有资质的建筑施工企业（被挂靠人）名义签订建设工程施工合同，并由挂靠人实际组织施工及承担全部经济责任，即可认定为挂靠行为。相关证据可能包括挂靠协议、双方权利义务的约定记录、资金往来凭证及施工过程中挂靠人组织管理等方面的材料。
接着，判断挂靠合同的效力。根据《中华人民共和国建筑法》及相关司法解释，挂靠施工合同因实际施工人无资质而无效。但是，如果建设工程经竣工验收合格，实际施工人仍有权请求参照合同约定支付工程价款。
二、优先通过协商和调解解决纠纷
友好协商：在确认挂靠关系和合同效力后，双方当事人应首选通过友好协商解决争议。这种方式成本最低、效率最高，有助于维护双方的合作关系。例如，双方可以就工程款结算数额进行详细核对，通过友好协商确定最终金额。
第三方调解：若协商无果，可邀请双方都信任的第三方介入调解，如行业协会、专业调解机构或有威望的专业人士，或政府主管部门、人民调解委员会等。第三方凭借其专业知识和中立地位，可以提出合理解决方案，促使双方和解。
三、法律途径解决纠纷
如果协商和调解均无法达成一致，那么可以通过法律途径解决纠纷：
仲裁：若挂靠合同中约定了仲裁条款或事后达成仲裁协议，双方应将纠纷提交给约定的仲裁机构裁决。仲裁具有专业性、高效性和保密性，裁决具有终局性，对双方均有约束力。
诉讼：若合同未约定仲裁条款或仲裁协议无效，任何一方可向有管辖权的人民法院提起诉讼。诉讼过程中需按法定程序提供证据，法院将依法审理并判决。对一审判决不服者，可在规定期限内提起上诉。
四、法律责任承担
在处理挂靠合同纠纷时，还需考虑法律责任承担问题：
连带责任：挂靠人与被挂靠人对发包人在工程质量、工程进度等方面造成的损失承担连带赔偿责任。
挂靠人内部责任：挂靠人作为实际施工人，因自身原因（如施工管理不善、偷工减料等）导致工程问题，应承担主要责任。被挂靠人在收取管理费等范围内可能需承担补充责任。
发包人过错责任：若发包人对挂靠行为明知或存在过错（如指定挂靠等），也需根据过错程度承担相应责任。
五、综合建议
收集证据：当事人在处理纠纷时应注重收集和保存相关证据，如挂靠合同、往来函件、付款凭证、施工记录等，以支持自己的主张。
遵循法律程序：所有行动应符合法律程序，必要时可寻求专业律师的帮助以获取更具体的法律建议。
选择合适方式：根据实际情况选择合适的解决方式，优先考虑协商和调解，以降低成本和提高效率；若无法协商解决，则可通过仲裁或诉讼途径维护自身权益。
综上所述，处理建筑工程合同纠纷中的挂靠问题需要综合考虑多个方面，遵循相关法律法规，选择合适的解决方式，并注重证据的收集和保存，以确保自身权益得到有效维护。