结论：在费率合同中，若未实际使用扬尘防治措施，通常不应计取该费用，但具体是否计取还需结合合同条款、实际履行情况及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同条款角度
合同明确约定：如果合同中明确规定了扬尘防治措施的费用计取条件，例如“若实际采取扬尘防治措施，则按XX标准计取费用”，那么未实际使用扬尘防治措施的情况下，按照合同约定，不应计取该费用。
合同未明确约定：若合同中未明确约定扬尘防治措施的费用计取条件，但提到了扬尘防治措施的相关要求或标准，此时需要结合合同的整体目的、行业惯例以及公平原则进行判断。如果未采取扬尘防治措施违反了合同目的或行业惯例，且可能给对方造成损失，那么即使合同未明确约定，也可能因违约而不应计取相关费用，甚至可能需要承担违约责任。
二、实际履行情况角度
未实际履行：如果在实际履行过程中，确实未采取任何扬尘防治措施，那么从实际履行的角度来看，不应计取该费用。因为费用的计取应当与实际履行情况相符，未履行则无费用可计。
部分履行或形式履行：如果虽然采取了一些扬尘防治措施，但并未达到合同或法律法规要求的标准，或者只是形式上的履行，那么是否计取费用以及计取多少费用，需要根据实际情况进行判断。如果部分履行或形式履行并未达到预期效果，且可能给对方造成损失，那么可能不应全额计取费用，甚至可能需要承担部分责任。
三、相关法律法规角度
环保法规要求：根据《中华人民共和国大气污染防治法》等相关法律法规，施工单位在施工过程中应当采取有效的扬尘防治措施，减少扬尘污染。如果未采取扬尘防治措施或采取的措施不符合要求，可能会受到环保部门的处罚。虽然这并不直接涉及费用计取问题，但可以作为判断是否应计取费用的一个参考因素。
合同纠纷处理原则：在处理合同纠纷时，应当遵循公平、诚实信用等原则。如果未采取扬尘防治措施而计取费用，可能违反了公平原则，损害了对方的利益。因此，在判断是否应计取费用时，需要综合考虑合同条款、实际履行情况以及相关法律法规的规定。
建议：在实际操作中，如果双方对是否应计取扬尘防治措施费用存在争议，建议首先查阅合同条款，了解双方的权利义务约定；其次，回顾实际履行情况，确认是否采取了扬尘防治措施以及采取的措施是否符合要求；最后，结合相关法律法规的规定进行综合判断。如果仍无法达成一致意见，可以考虑通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。如有具体法律问题，可以直接向我咨询。