在交通事故案件中，被告司机方垫付的医疗费，最终应赔付给受害者或其家属，具体赔付方式和比例需根据事故责任认定和保险情况来确定。以下从不同角度进行详细分析：
一、事故责任认定是基础
全责或主责情况：
- 如果被告司机被认定为全责或主要责任方，那么其垫付的医疗费，在扣除交强险和商业险已赔付的部分后，剩余部分应全额或按责任比例赔付给受害者或其家属。
- 例如，若交强险医疗费限额为1.8万元，商业险赔付了2万元，而实际医疗费为5万元，那么被告司机垫付的超出3.8万元的部分，应赔付给受害者或其家属。
次责或无责情况：
- 如果被告司机被认定为次要责任或无责任方，那么其垫付的医疗费，可能只需承担部分赔付责任，或者根据具体情况，可能不需要赔付，而是由受害者自行承担或通过其他途径（如救助基金）解决。
- 例如，若被告司机被认定为次要责任，且责任比例为30%，那么其垫付的医疗费中，只需承担30%的赔付责任，剩余部分由受害者或其他责任方承担。
二、保险赔付是重要环节
交强险赔付：
- 交强险是强制性的车辆保险，其医疗费赔付限额一般为1.8万元。在事故发生后，保险公司应首先在交强险责任限额内赔付受害者的医疗费。
- 如果被告司机已垫付了医疗费，且该费用在交强险赔付范围内，那么保险公司应将赔付款项直接支付给被告司机（或根据被告司机的指示支付给受害者或其家属）。
商业险赔付：
- 如果肇事车辆投保了商业第三者责任险，且符合保险合同约定的赔付条件，那么保险公司应在商业险范围内赔付受害者的医疗费。
- 被告司机垫付的医疗费中，超出交强险赔付范围的部分，如果符合商业险赔付条件，应由保险公司赔付给被告司机（或根据被告司机的指示支付给受害者或其家属）。
三、特殊情况下的处理
道路交通事故社会救助基金：
- 在特定情况下（如抢救费用超过交强险责任限额、肇事机动车未参保交强险或机动车肇事后逃逸），道路交通事故社会救助基金可先行垫付受害者的抢救费用。
- 如果被告司机已垫付了医疗费，且该费用符合救助基金垫付条件，那么救助基金在垫付后，有权向责任方（包括被告司机）追偿。
受害者自行垫付或其家属垫付：
- 在肇事方和保险公司未能及时垫付医疗费时，受害者及其家属可能需要先自行承担医疗费用。
- 之后，受害者或其家属可通过协商、调解或诉讼等方式，向责任方和保险公司索赔，包括被告司机垫付的医疗费部分。
四、法律建议
保留证据：
- 被告司机在垫付医疗费时，应保留好所有相关证据和记录，包括医疗费发票、支付凭证、事故责任认定书等，以便后续追偿和结算。
及时沟通：
- 被告司机应与受害者、保险公司和交警部门保持及时沟通，了解事故处理进展和赔付情况，确保自己的权益得到保障。
法律维权：
- 如果在处理过程中遇到纠纷或争议，被告司机应及时咨询专业律师（即我），了解自己的法律权益和义务，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。
综上所述，交通事故案件中被告司机方垫付的医疗费，最终应赔付给受害者或其家属，具体赔付方式和比例需根据事故责任认定和保险情况来确定。在处理过程中，各方应保持冷静和理性，积极沟通协商，并充分利用法律资源和救助机制来寻求最合理的解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。