关于物资采购合同中逾期付款违约金每日多少合法的问题，这并非一个固定数值，而是需要依据合同中的具体约定、实际损失情况，并参照相关法律法规及司法解释来综合确定。以下是对此问题的详细解答：
一、合同有明确约定的情况
合同自治原则：根据合同法的相关规定，如果合同双方对逾期付款违约金的计算方式有明确且具体的约定，并且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么一般应按照该约定来执行。例如，合同中可能约定逾期付款违约金为每日万分之三或万分之五等。
调整情形：然而，如果约定的违约金过分高于或低于实际造成的损失，根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人有权请求人民法院或仲裁机构予以适当调整。在司法实践中，通常认为违约金超过造成损失的30%可能会被认定为“过分高于造成的损失”。
二、合同无约定或约定不明确的情况
法定标准：当合同中没有约定逾期付款违约金或其计算方法时，根据相关司法解释，出卖人主张赔偿逾期付款损失的，其计算方式会有所不同。具体来说，如果违约行为发生在2019年8月19日之前，以中国人民银行同期同类人民币贷款基准利率为基础，参照逾期罚息利率标准计算；如果违约行为发生在2019年8月20日之后，则以违约行为发生时中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心公布的一年期贷款市场报价利率（LPR）标准为基础，加计30%—50%计算逾期付款损失。
参照金融机构标准：在无明确约定的情况下，当事人也可以主张违约金参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准来计算。
以实际损失为基础：无论是哪种情况，法院或仲裁机构在判断违约金是否合理时，都会以实际损失为基础，综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度等因素。一般来说，违约金的数额不应超过实际损失的30%。
三、实际操作中的建议
明确约定：为了避免纠纷的发生，建议在物资采购合同中明确约定逾期付款违约金的计算方式、标准和累计总额的上限。
合法合理：确保约定的违约金条款既合法又合理，与实际损失相匹配，避免过高或过低的约定。
灵活调整：在合同履行过程中，如遇特殊情况导致逾期付款，双方可协商调整违约金，以体现合同的灵活性和合作精神。
综上所述，物资采购合同中逾期付款违约金每日的合法数额并非固定不变，而是需要根据合同中的约定、实际损失情况以及相关法律法规和司法解释的规定来综合确定。在处理相关纠纷时，应综合考虑各种因素，以确保违约金的合理性及合法性。