以罚款阻止员工越级上访是否违法需分情况讨论，具体结论如下：

1. 若企业罚款行为缺乏法律依据，则属于违法行为
   根据《劳动合同法》及《行政处罚法》，企业并非行政机关，无权对员工实施行政处罚（如罚款）。若企业以“越级上访”为由直接扣减工资或罚款，需满足两个条件：
   

• 员工行为严重违反公司规章制度（如规章制度中明确规定“越级上访属于严重违纪”）；
  
• 规章制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）并公示告知员工。
  若未满足上述条件，企业罚款行为涉嫌违法，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁要求返还罚款。

1. 若企业罚款行为合法，但限制员工上访权利则可能违法
   即使企业罚款行为合法（如基于规章制度），但上访是公民的法定权利（《信访条例》明确规定公民有权向各级机关反映问题）。若企业通过罚款变相剥夺员工上访权利（如规定“上访即开除”），则可能涉嫌侵犯员工合法权益，员工可主张该条款无效。

2. 企业合法管理建议
   企业若希望规范员工行为，可采取以下合法方式：

• 通过内部沟通机制（如逐级汇报）引导员工解决问题；
  
• 对违反规章制度的行为（如旷工、泄密等）依法处理，但需避免与“上访”行为直接关联；
  
• 若员工上访内容涉及企业违法违规，企业应主动整改而非压制。

总结：企业以罚款阻止越级上访的合法性取决于罚款依据是否充分，但任何情况下均不得剥夺员工上访权利。若您遇到类似情况，可进一步向我咨询具体操作细节。