被供货方处以的罚款能否扣除及如何扣除，需根据罚款性质、合同约定及法律规定综合判断，具体分析如下：

1. 若罚款属于合同约定的违约金

   • 扣除依据：根据《民法典》第五百八十五条，当事人可约定一方违约时向对方支付违约金。若供货合同中明确约定了罚款条款（如逾期交货、质量不达标等），且该条款不违反法律强制性规定（如违约金过高可请求法院调整），则买方有权按合同约定扣除罚款。
     
   • 操作方式：需在付款时直接抵扣货款，或要求供货方另行支付罚款。建议通过书面形式（如对账单、扣款通知）明确扣除金额及依据，避免纠纷。
     

2. 若罚款属于行政处罚或第三方罚款

   • 不可直接扣除：若供货方因违反行政法规（如环保、税务）被行政机关处罚，或因第三方索赔产生罚款，此类费用与买卖合同无关，买方无权直接从货款中扣除。
     
   • 例外情形：若合同明确约定“供货方需承担因自身违法导致的买方损失”（包括行政罚款），则买方可依据合同主张赔偿，但需通过诉讼或仲裁程序解决，而非直接扣款。
     

3. 若罚款性质存疑或合同未约定

   • 协商优先：双方可协商确定罚款金额及支付方式，并签订补充协议。
     
   • 法律途径：若协商不成，买方可依据《民法典》第五百七十七条（违约责任）或第五百八十四条（损失赔偿）起诉供货方，要求赔偿实际损失（需举证损失与供货方违约的因果关系）。
     

风险提示：

• 未经合同约定或法律授权直接扣款，可能被认定为“不当得利”或“违约”，供货方有权要求返还并主张利息或赔偿。
  
• 建议在合同中明确罚款条款（如适用情形、计算方式、支付期限），并保留供货方违约的证据（如检测报告、沟通记录）。
  

如有具体合同条款或罚款情形，可进一步向我咨询，我会结合细节提供针对性建议。