行政单位可以与企业联合参与政府采购招标，但合同是否分开签订需视具体情况和招标文件要求而定。以下是对这一问题的详细分析：

一、行政单位与企业联合招标的合法性

在政府采购中，行政单位与企业联合参与招标是合法的，但需要满足一定的条件。根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，政府采购活动应当遵循公开透明原则、公平竞争原则、公正原则和诚实信用原则。只要联合招标的各方均符合政府采购的供应商资格要求，且联合招标的行为不违反这些原则，就是合法的。

二、合同签订方式

关于合同是否分开签订，这主要取决于招标文件的具体要求以及联合招标各方的协商结果。

1. 招标文件要求：

   • 如果招标文件明确规定了合同签订的方式，比如要求联合招标的各方共同与采购人签订一份合同，或者允许各方分别与采购人签订合同，那么应当按照招标文件的要求执行。

2. 联合招标各方的协商：

   • 如果招标文件没有明确规定合同签订的方式，那么联合招标的各方可以协商确定。在协商过程中，各方可以考虑项目的实际情况、各自的责任和义务、风险分配等因素，来决定是共同签订一份合同还是分别签订合同。

三、实际操作中的建议

1. 仔细阅读招标文件：

   • 在参与政府采购招标前，务必仔细阅读招标文件，了解其中的各项要求和规定，特别是关于合同签订方式的部分。

2. 明确各方责任和义务：

   • 如果决定联合招标，各方应当明确各自的责任和义务，包括项目实施、质量保证、售后服务等方面的责任。这有助于在合同签订和执行过程中避免纠纷。

3. 协商确定合同签订方式：

   • 在联合招标过程中，各方应当就合同签订方式进行充分协商，并达成一致意见。如果可能的话，可以将协商结果写入联合招标协议中，以作为后续签订合同的依据。

4. 遵守相关法律法规：

   • 在合同签订和执行过程中，各方应当严格遵守相关法律法规和政府采购的规定，确保合同的合法性和有效性。

举例说明：假设某行政单位与一家企业联合参与一个政府采购项目的招标，招标文件没有明确规定合同签订的方式。在联合招标过程中，双方协商决定共同与采购人签订一份合同，并明确各自在项目实施、质量保证等方面的责任和义务。这样的做法是合法的，也是可行的。

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