结论：这种情况可能构成程序瑕疵，但具体是否构成程序违法，需结合庭审实际情况、证据规则及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、从庭审程序规范角度分析

1. 质证环节的法定性
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，庭审质证是法定必经程序。证据必须经当庭出示、辨认、辨认等质证活动，未经质证的证据不得作为定案依据（《刑事诉讼法》第61条）。若庭审笔录中完全缺失质证记录，可能违反法定程序。

2. 判决书“自证”表述的合理性
   判决书中的“自证”字样需结合上下文判断：

   • 若指被告人自行举证（如被告人主动提交证据），则需审查该证据是否经当庭质证。若未质证，属于程序违法；
     
   • 若指法院直接认定被告人陈述为证据（如被告人供述），则需审查供述是否经当庭质证。根据《刑事诉讼法》第56条，被告人供述需经查证属实且排除非法取证可能后，方可作为定案依据。若未质证，同样可能违法。

二、从证据规则角度分析

1. 质证缺失的法律后果
   若庭审中确实未进行质证，但判决书却引用相关证据，属于“证据未经质证即被采纳”，违反《刑事诉讼法》第61条。根据《刑事诉讼法》第238条，此类情形可能构成“违反法定诉讼程序”，当事人可申请二审法院撤销原判、发回重审。

2. 例外情形
   若质证环节实际存在但笔录遗漏（如书记员记录疏漏），需结合庭审录像、其他笔录或参与人证言补正。若能证明质证实际发生，则不构成程序违法。

三、从当事人救济角度分析

1. 申请补正或异议
   若发现庭审笔录与判决书矛盾，当事人可：

   • 向法院提出书面异议，要求补正笔录或说明情况；
     
   • 在上诉或申诉中主张“程序违法”，要求二审法院审查。

2. 关键证据：庭审录像与笔录对比
   若法院有庭审录像，可申请调取录像核实质证环节是否实际发生。若录像显示质证存在，则笔录遗漏属记录瑕疵；若录像亦无质证，则可能构成程序违法。

四、实务建议

1. 立即核对庭审笔录与判决书
   仔细比对两者内容，明确“自证”具体指向（如证据类型、质证情况），并整理相关证据（如庭审录像、其他笔录）。

2. 向法院提出书面异议
   若发现程序问题，可提交《庭审程序违法异议书》，要求法院补正或说明。若法院未回应，可在上诉或申诉中主张权利。

3. 咨询专业律师协助
   程序违法问题需结合具体案情分析，建议携带庭审笔录、判决书等材料，向我进一步咨询。我将根据证据规则和司法实践，为您制定针对性维权方案。

总结：庭审笔录缺失质证环节但判决书引用证据，可能构成程序瑕疵或违法。当事人需通过核对笔录、调取录像、提出异议等方式固定证据，并在必要时通过法律程序维护权益。如有疑问，可直接向我咨询具体案件情况。