在刑事案件中，若当事人存在脑子上的疾病（通常指精神疾病或智力障碍等影响认知、行为能力的状况），处理方式需根据具体情况而定，核心结论是：司法机关会先对当事人的刑事责任能力进行鉴定，再依据鉴定结果决定是否承担刑事责任及如何承担。具体如下：

1. 刑事责任能力鉴定是关键前提
   根据《刑法》第18条，司法机关会委托专业机构对当事人进行精神病学鉴定，重点判断其作案时是否具有辨认或控制自己行为的能力。鉴定结论分为三类：

   • 完全无刑事责任能力：若当事人作案时因精神疾病丧失辨认或控制能力，不负刑事责任，但可能被强制医疗（如严重危害社会且具有继续危害可能性的）；
     
   • 限制刑事责任能力：若当事人作案时辨认或控制能力明显减弱，可从轻或减轻处罚；
     
   • 完全刑事责任能力：若当事人虽患有精神疾病，但作案时具有完全辨认和控制能力，需承担全部刑事责任。

2. 鉴定后的处理方式因结果而异

   • 不负刑事责任的情况：若鉴定为完全无刑事责任能力，案件会终止刑事诉讼程序，但司法机关可责令家属或监护人严加看管和医疗；必要时由政府强制医疗（如《刑事诉讼法》第302条规定的“实施暴力行为，危害公共安全或严重危害公民人身安全，经法定程序鉴定依法不负刑事责任的精神病人”）。
     
   • 需承担刑事责任的情况：若鉴定为限制或完全刑事责任能力，案件会继续刑事诉讼程序，但量刑时会考虑精神状况对责任能力的影响。例如，限制刑事责任能力者可能被判处缓刑、减刑或适用非监禁刑（如社区矫正）。

3. 家属或监护人的配合义务
   无论鉴定结果如何，家属或监护人均需配合司法机关的工作：

   • 提供当事人的病史、治疗记录等材料；
     
   • 监督当事人按时服药、接受治疗；
     
   • 若当事人被强制医疗或判处非监禁刑，需确保其遵守相关规定（如定期报告、禁止接触特定人员等）。

4. 特殊情形：智力障碍者的处理
   若当事人是智力障碍者（如精神发育迟滞），鉴定时会重点评估其智商（IQ）和社会适应能力。根据《刑法》第18条第3款，尚未完全丧失辨认或控制自己行为能力的智力障碍者犯罪，可从轻或减轻处罚；若完全丧失辨认能力，则不负刑事责任。

总结：刑事案件中当事人的精神或智力状况会直接影响其刑事责任认定，司法机关会通过专业鉴定明确责任能力，再依法决定是否追究刑事责任及如何处罚。家属或监护人需积极配合，确保当事人得到合理处置。若有具体案件细节需要进一步分析，可直接向我咨询。