单位公车司机擅自搭载职工发生交通事故，责任承担问题需分情况讨论：
司机责任角度
- 若司机存在故意或重大过失：比如司机酒驾、超速、违规驾驶等，导致交通事故发生，那么司机应当承担主要的赔偿责任。根据《民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在这种情况下，司机因其过错行为导致职工受伤或财产损失，自然应当承担相应的赔偿责任。
- 若司机无故意或重大过失：如果司机在驾驶过程中遵守交通规则，没有违规行为，但因其他不可预见、不可避免的因素（如突发机械故障、第三方违规等）导致交通事故，那么司机可能不承担或承担较少的赔偿责任。不过，这并不意味着司机完全无责，具体还需根据事故的具体情况和相关法律法规来判断。
单位责任角度
- 单位对司机管理不善：如果单位对公车司机管理不善，比如未对司机进行必要的交通安全培训、未定期检查车辆状况等，导致司机在驾驶过程中存在安全隐患，那么单位可能因管理不善而承担一定的赔偿责任。根据《民法典》中关于用人单位责任的规定，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。虽然这里讨论的是擅自搭载职工的情况，但如果单位的管理行为与事故发生存在因果关系，单位仍可能承担一定责任。
- 单位对车辆管理不善：如果单位对公车的管理存在漏洞，比如车辆未定期保养、维修，导致车辆存在安全隐患，或者单位未对公车的使用进行严格监管，允许司机擅自搭载他人等，那么单位也可能因车辆管理不善而承担一定的赔偿责任。
职工自身责任角度
- 职工明知司机违规仍乘坐：如果职工明知司机存在违规行为（如酒驾、超速等），但仍选择乘坐，那么职工自身也可能存在一定的过错。在这种情况下，职工可能需要承担一部分责任，具体比例需根据事故的具体情况和相关法律法规来判断。
- 职工未系安全带等自身原因：如果职工在乘坐过程中未系安全带等自身原因导致受伤加重，那么职工自身也可能需要承担一部分责任。因为安全带是保护乘客安全的重要设备，乘客有义务在乘车时系好安全带。
法律建议：
- 对于单位而言，应加强对公车司机的管理和培训，定期检查车辆状况，确保公车安全使用。同时，应制定严格的公车使用规定，禁止司机擅自搭载他人，以减少潜在的法律风险。
- 对于司机而言，应严格遵守交通规则，确保安全驾驶。在搭载他人时，应确保对方同意并了解相关风险，避免因此产生纠纷。
- 对于职工而言，在乘坐公车时，应了解司机的驾驶状态和车辆状况，确保自身安全。如果发现司机存在违规行为或车辆存在安全隐患，应及时提出并拒绝乘坐。
后续行动建议：
- 如果发生此类交通事故，建议立即报警并保护好现场，以便交警部门进行事故认定和责任划分。
- 同时，建议及时咨询专业律师，了解自身的法律权益和可能的赔偿途径。律师可以根据事故的具体情况和相关法律法规，为你提供专业的法律建议和帮助。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。