公司换掉自然人股东，通常涉及的是股东变更的相关法律程序和权益处理。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、股东变更的法律程序

1. 股东会决议：

   • 公司股东会的决议是股东变更的前提。根据《公司法》的相关规定，股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。对于股东变更，虽然不一定需要三分之二以上表决权，但通常需要股东会作出有效决议。

2. 签订股权转让协议：

   • 股东变更通常通过股权转让的方式实现。出让方与受让方应签订股权转让协议，明确双方的权利义务，包括转让价格、支付方式、股权交付时间等。

3. 修改公司章程：

   • 股权转让后，公司应修改公司章程中关于股东及其出资额的记载，以反映新的股权结构。

4. 办理工商变更登记：

   • 根据《公司法》和《公司登记管理条例》的规定，公司应自股东发生变更之日起30日内申请变更登记，并提交相关材料，如股东会决议、股权转让协议、修改后的公司章程等。

二、股东变更中的权益处理

1. 股权转让价格的确定：

   • 股权转让价格应由出让方与受让方协商确定，可以参考公司的净资产、盈利能力、市场前景等因素。如果双方无法达成一致，可以委托评估机构进行评估。

2. 优先购买权的行使：

   • 根据《公司法》的规定，经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东享有优先购买权。因此，在股权转让过程中，应尊重其他股东的优先购买权，避免引发纠纷。

3. 股权转让的税费处理：

   • 股权转让可能涉及所得税、印花税等税费。出让方和受让方应按照税法规定缴纳相关税费，避免税务风险。

三、特殊情况下的股东变更

1. 继承导致的股东变更：

   • 如果自然人股东因死亡而发生继承，其继承人可以继承其股东资格。此时，公司应办理相应的工商变更登记手续，将继承人登记为新的股东。

2. 法院强制执行导致的股东变更：

   • 如果自然人股东的股权被法院强制执行，如拍卖、变卖等，受让人在取得股权后，公司也应办理相应的工商变更登记手续。

四、法律建议

1. 在股东变更过程中，应严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保程序的合法性和合规性。
2. 在签订股权转让协议时，应明确双方的权利义务和违约责任，以避免后续纠纷。
3. 如果涉及复杂的股权转让或存在争议，建议咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。

如果您在公司股东变更过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律解答和帮助。