针对您提出的“自然人独资有限公司股东怎么更换法人”的问题，首先需要明确的是，自然人独资企业（通常指的是个人独资企业）在法律上并不具备“股东”这一概念，因为它是由一个自然人投资设立，且不具备法人资格。不过，如果您想要了解的是如何更换这类企业的“负责人”或“经营者”（在个人独资企业中，这通常与投资人是同一人），或者是在自然人独资企业转变为有限责任公司后如何更换法人代表，我可以分别进行解答。
对于自然人独资企业（个人独资企业）
理解企业性质：
- 个人独资企业由单一自然人投资并控制，不具有法人资格，因此不存在“股东”变更的问题。
更换经营者或投资人的方式：
- 若需更换经营者或投资人，通常需要通过注销原企业并重新设立新企业，或者通过合法转让经营权的方式实现。
- 注销原企业：按照法定程序办理注销手续，包括清算债务、税务注销等。
- 重新设立新企业：由新的投资者按照法定程序重新设立一个新的个人独资企业。
- 经营权转让：与新经营者签订转让协议，明确双方的权利和义务，并按照相关规定办理转让手续。
注意事项：
- 在整个过程中，应确保所有操作的合法性和合规性，避免可能的法律风险。
- 建议咨询专业的法律人士或机构，以获得详细的法律指导和支持。
对于自然人独资企业转变为有限责任公司后
若您的自然人独资企业已经转变为有限责任公司，并希望更换法人代表，则需遵循以下步骤：
股东会决议：
- 召开股东会，就更换法人代表的事项进行决议，并形成书面决议文件。
准备变更材料：
- 包括股东会决议、新任法人代表的身份证明、公司章程修正案（如涉及公司章程修改）等。
提交申请与审批：
- 向当地工商行政管理部门提交变更申请，包括《公司变更登记申请书》及相关材料。
- 工商部门审核通过后，办理变更登记手续，换发新的营业执照。
税务与其他变更：
- 完成工商变更后，需向税务部门提交税务变更申请，更新税务登记信息。
- 同时，可能还需向银行、社保等其他相关部门提交变更申请，更新相关信息。
总结与建议
- 对于自然人独资企业（个人独资企业），由于不存在“股东”概念，因此无法直接更换“股东”。若需更换经营者或投资人，需通过注销原企业并重新设立新企业或转让经营权等方式实现。
- 若自然人独资企业已转变为有限责任公司，并希望更换法人代表，则需按照公司法的相关规定，通过股东会决议、准备变更材料、提交申请与审批等步骤完成变更。
- 在整个过程中，建议咨询专业的法律人士或机构，以确保操作的合法性和有效性，避免可能的法律风险。
希望以上解答能够对您有所帮助。如有任何进一步的问题或需要进一步的法律支持，请随时咨询。