有限责任公司自然人投资情形下更换法人（法定代表人），核心步骤如下：

1. 内部决策程序
   根据《公司法》第13条及公司章程规定，更换法定代表人需经股东会或董事会决议：

   • 若公司章程约定由股东会选举/更换法定代表人，需召开股东会并经代表三分之二以上表决权的股东通过（章程另有约定除外）；
     
   • 若约定由董事会选举，则需董事会决议通过（需过半数董事出席且过半数同意）。
     提示：若公司仅有一名自然人股东，可直接通过股东决定书完成决议。

2. 修改公司章程（如需）
   若原章程中法定代表人由特定人员（如原执行董事）担任，而新法定代表人拟由其他人（如经理）担任，需同步修改章程中关于法定代表人任职的条款，并经股东会表决通过。

3. 办理工商变更登记
   自决议作出之日起30日内，向公司登记机关（市场监管局）提交以下材料：

   • 《公司登记（备案）申请书》；
     
   • 股东会/董事会决议原件；
     
   • 新任法定代表人的任职文件（如董事会决议、经理聘任书等）；
     
   • 营业执照正副本原件；
     
   • 若涉及章程修改，需提交修改后的章程或章程修正案。
     注意：部分地区可能要求新法定代表人签署《企业登记承诺书》，承诺无禁止任职情形（如被列入失信名单、正在服刑等）。

4. 后续事项

   • 刻制新法定代表人名章（如需）；
     
   • 更新银行、税务、社保等部门登记的法定代表人信息；
     
   • 若原法定代表人同时担任董事、监事等职务，需另行办理相关职务的变更登记。

风险提示：

• 若原法定代表人拒不配合交接或存在损害公司利益行为，可通过股东会决议免除其职务，并依法追究其责任；
  
• 变更过程中需确保程序合法，否则可能面临工商部门驳回申请或行政处罚；
  
• 新法定代表人需承担《公司法》规定的忠实勤勉义务，若因故意或重大过失损害公司利益，可能需承担赔偿责任。
  

如有具体操作疑问或需审查变更文件，可进一步向我说明公司章程条款及决议内容，我会为您详细分析。