自然人公司变更股东是可行的，但需遵循相关法律法规的规定。具体分析如下：

一. 公司类型与股东变更

1. 一人有限责任公司：若所指的“自然人公司”为一人有限责任公司（即只有一个自然人股东或一个法人股东的有限责任公司），根据《中华人民共和国公司法》第五十七条，这种公司的股东是可以变更的。股东变更可能涉及股权转让、公司章程修改、工商登记变更等步骤，需按照相关法律规定进行操作。
2. 个人独资企业：若实际上是指个人独资企业（由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体），虽然其“投资人”可以变更，但变更流程与公司制企业有所不同，且需遵循《个人独资企业法》的相关规定。

二. 股东变更的法律依据与流程

1. 法律依据：无论是有限责任公司还是个人独资企业，股东或投资人的变更都需遵循相关法律法规，如《中华人民共和国公司法》、《个人独资企业法》等。
2. 变更流程：通常包括股权转让协议的签订、公司章程的修改、工商登记信息的变更等步骤。具体流程可能因地区和企业类型而有所不同，但均需确保所有变更程序和文件符合法律法规的要求。

三. 税务考虑

1. 印花税：根据印花税暂行条例，股权转让需按所载金额的万分之五贴花。
2. 个人所得税：若自然人股东通过股权转让获取收益，该收益属于“财产转让所得”，需按20%的比例税率缴纳个人所得税。应纳税所得额 = 股权转让收入 - 股权原值 - 合理费用。

我建议在进行股东变更前，应充分了解相关法律法规和税务规定，确保所有步骤合法合规。同时，建议咨询当地工商部门和税务机关，以获取具体的操作指导和税务处理建议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。