您好，单位扣押您的职工资格证是不合法的行为，下面我为您详细解释一下相关法律依据和应对措施。
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定，用人单位在招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，这里的“其他证件”明确包括了劳动者个人的各类资格证书。资格证书是您个人能力和资质的证明，具有个人属性，您对其依法享有所有权和使用权，单位是无权扣押的。同时，该条款还明确规定了用人单位不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。
二、特殊情况说明
虽然一般情况下单位扣押资格证书是不合法的，但也存在一些特殊情况。比如，如果您与单位签订了合法有效的协议，并且明确约定在特定项目或服务期限内，为了保障工作的正常开展，您同意将资格证书交由单位统一管理使用，且协议中详细规定了使用范围、归还条件等具体条款，那么这种基于双方平等自愿、协商一致且不违反法律法规强制性规定的“保管”行为，可能具有一定的合法性。但这种情况非常罕见，且必须严格遵守法律规定。
三、应对措施
如果单位非法扣押了您的资格证书，您可以采取以下措施来维护自己的权益：
与单位协商：首先，您可以尝试与单位进行沟通，了解扣押的原因，并争取通过友好协商的方式解决问题。这是最为直接且成本较低的解决方式。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察大队或其他相关部门进行投诉。在投诉时，请详细说明被扣押的证书名称、对个人生活或就业的影响等具体情况。劳动监察部门将依法进行调查，并责令单位限期退还扣押的资格证书。
提起法律诉讼：如果单位拒不退还扣押的资格证书，您可以委托专业律师提起民事诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明单位扣押了资格证书以及该行为给您造成的损失。法院将根据事实和法律规定作出公正判决，维护您的合法权益。
四、注意事项
在维权过程中，请您注意保存相关证据，如劳动合同、证书被扣留的相关证明（如聊天记录、邮件通知等）、因证书被扣押导致的损失证明等。这些证据将在协商、投诉或诉讼过程中发挥重要作用。同时，如果单位扣押资格证书的行为给您造成了实际损失，如无法就业、影响升职加薪等，您还有权要求单位承担相应的赔偿责任。
综上所述，单位扣押您的职工资格证是不合法的行为。在遇到此类情况时，请您依法采取相应措施来维护自己的合法权益。希望这些信息能对您有所帮助。