单位扣押医师证件是违法的，单位或用人单位不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析和解答：

1. 法律法规明确禁止扣押证件：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条，用人单位招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，这明确包括了医师证件在内的所有个人证件。

2. 单位扣押证件的法律后果：

   • 如果单位违反了这一规定，扣押了医师的证件，那么该行为是违法的，医师有权要求单位立即返还。

3. 医师的应对措施：

   • 与单位沟通：首先，医师可以尝试与单位进行沟通，明确要求单位返还被扣押的证件。
   • 向劳动监察部门投诉：如果单位拒绝返还，医师可以向当地的劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对单位进行查处。
   • 寻求法律援助：在必要时，医师还可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

4. 预防类似情况的发生：

   • 医师在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，确保其中没有关于扣押证件的条款。
   • 在日常工作中，医师也应时刻关注自己的证件是否安全，防止被单位或其他人员非法扣押。

综上所述，单位扣押医师证件是违法的，医师有权要求单位返还，并可以通过沟通、投诉或法律途径来维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。