结论前置：您可以按照以下步骤撰写申请补发工资的申请书，并附上相关证据材料，以维护自身合法权益。

撰写申请补发工资申请书的具体步骤与要点：

1. 明确申请目的与事实依据

   • 目的：在申请书的开头部分，直接、明确地表达您申请补发工资的目的，即因公司未设置实习期而多扣了您的工资，现要求公司予以补发。
   • 事实依据：详细阐述您入职时的情况，包括入职时间、职位、劳动合同中关于薪资的约定等。特别指出，劳动合同或公司规章制度中并未规定实习期，但公司却以实习期为由扣除了您部分工资。

2. 列举扣减工资的具体情况

   • 时间范围：明确指出公司从何时开始以实习期为由扣减您的工资，以及扣减的持续时间。
   • 扣减金额：详细列出每次扣减的具体金额，以及累计扣减的总金额。如果可能的话，附上工资条或银行转账记录等证据，以证明扣减事实的存在。

3. 引用相关法律法规

   • 在申请书中，您可以适当引用《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规中关于工资支付、劳动合同订立与履行等方面的规定，以支持您的申请。例如，可以指出根据《劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

4. 表达合理诉求与期望

   • 在申请书的结尾部分，明确表达您的合理诉求，即要求公司立即补发因无实习期而多扣的工资，并承诺今后将严格按照劳动合同和法律法规的规定支付您的工资。
   • 同时，您可以表达对公司能够积极处理此事、维护员工合法权益的期望，以及如果公司未能妥善处理，您将考虑采取进一步法律措施的决心。

示例申请书框架：

申请补发工资申请书

尊敬的[公司名称]领导：

您好！

我是[部门名称]的[员工姓名]，于[入职日期]入职贵公司，担任[职位名称]。根据我与公司签订的劳动合同，我的月薪为[具体金额]元，且合同中并未规定实习期。然而，自入职以来，公司却以实习期为由，每月扣除了我[具体金额]元的工资，至今已累计扣减[总金额]元。

我认为，公司的这一做法违反了《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，侵犯了我的合法权益。因此，我特向公司提出申请，要求立即补发因无实习期而多扣的[总金额]元工资。

我期望公司能够重视此事，积极处理，并承诺今后将严格按照劳动合同和法律法规的规定支付我的工资。如果公司未能妥善处理此事，我将不得不考虑采取进一步的法律措施来维护自己的合法权益。

此致 敬礼！

申请人：[员工姓名] 日期：[申请日期]

在撰写申请书时，请务必保持客观、理性的态度，避免使用过激或情绪化的言辞。同时，确保申请书中的事实依据充分、准确，以便公司能够认真对待并妥善处理您的申请。如有需要，您也可以随时向我咨询相关法律问题。