在行政处罚过程中，若扣押程序违法，并不必然导致整个行政处罚决定违法，但可能成为确认行政处罚决定违法的一个因素，具体需分情况讨论：
扣押程序违法对行政处罚决定效力的直接影响
程序轻微违法，不影响实体决定：如果扣押程序的违法属于轻微违法，例如未严格遵循某些形式要件（如未及时出具扣押清单但实际扣押物品无误），且该违法并未对当事人的合法权益造成实质性损害，同时行政处罚决定的实体内容（如违法事实的认定、处罚种类的选择、处罚幅度的确定等）均合法合理，那么在这种情况下，扣押程序的违法可能不会直接导致整个行政处罚决定被确认违法。法院或行政复议机关在审查时，可能会认为该程序违法属于“程序瑕疵”，不足以影响行政处罚决定的合法性。
程序严重违法，影响实体决定：如果扣押程序的违法属于严重违法，例如未依法出示执法证件、未告知当事人扣押的理由和依据、扣押物品与案件无关或超出必要范围等，且该违法直接影响了当事人合法权益的保障或行政处罚决定的实体内容（如因违法扣押导致关键证据灭失，进而影响了违法事实的认定），那么在这种情况下，扣押程序的违法很可能成为确认整个行政处罚决定违法的一个关键因素。法院或行政复议机关在审查时，会认为该程序违法已经严重违反了法定程序，损害了当事人的合法权益，因此应当确认行政处罚决定违法。
法律后果与救济途径
行政复议：当事人认为行政处罚过程中的扣押程序违法，且该违法影响了行政处罚决定的合法性时，可以依法向作出行政处罚决定的行政机关的上一级行政机关申请行政复议。在行政复议过程中，复议机关会对行政处罚决定的合法性进行全面审查，包括扣押程序的合法性。如果复议机关认为扣押程序违法且影响了行政处罚决定的合法性，那么复议机关有权撤销或变更该行政处罚决定。
行政诉讼：当事人对行政复议决定不服的，或者认为行政处罚决定直接侵犯其合法权益的，可以依法向人民法院提起行政诉讼。在行政诉讼过程中，法院会对行政处罚决定的合法性进行司法审查，包括扣押程序的合法性。如果法院认为扣押程序违法且影响了行政处罚决定的合法性，那么法院有权判决撤销或部分撤销该行政处罚决定，并可以判决被告重新作出行政行为。
实务建议
保留证据：当事人在面对行政处罚过程中的扣押行为时，应当注意保留相关证据，如扣押清单、执法人员的证件信息、现场照片或视频等，以便在后续的行政复议或行政诉讼中证明扣押程序的违法性。
及时咨询：如果当事人对行政处罚决定或扣押程序有疑问或不满，应当及时咨询专业律师，了解自己的合法权益和救济途径。律师可以根据当事人的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。
依法维权：当事人在认为自己的合法权益受到侵害时，应当依法通过行政复议或行政诉讼等途径维护自己的合法权益。在维权过程中，当事人应当遵守法律法规和程序规定，不得采取非法手段或暴力行为。
综上所述，行政处罚过程中的扣押程序违法并不必然导致整个行政处罚决定违法，但可能成为确认行政处罚决定违法的一个因素。具体是否违法以及法律后果如何，需要根据扣押程序违法的性质、程度以及对行政处罚决定实体内容的影响等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。