若小车事故中对方被认定为主责，但保险公司不认可，可按以下步骤处理：

1. 核查事故责任认定书：首先确认交警部门出具的事故责任认定书是否明确、无误。该认定书是处理事故赔偿的重要依据，具有法律效力。若保险公司不认可，可要求其提供不认可的具体理由及证据。

2. 与保险公司沟通协商：在确认责任认定书无误后，主动与对方保险公司进行沟通，了解其不认可的具体原因。可能是保险公司对事故情况存在误解，或是认为存在某些免责条款。通过沟通，可以尝试达成共识，推动赔偿事宜的进展。

3. 申请复核或鉴定：若与保险公司沟通无果，且保险公司坚持不认可责任认定，可考虑向交警部门申请对事故责任进行复核，或委托第三方机构进行事故鉴定。这些程序旨在提供更客观、权威的证据，以支持责任认定书的结论。

4. 提起诉讼：若经过上述步骤仍无法解决问题，且对方保险公司拒绝赔偿或赔偿金额不合理，可考虑向法院提起诉讼。在诉讼过程中，需提供充分证据证明对方的主责地位及自身损失情况，以争取法院的支持和判决。

在处理过程中，还需注意以下几点：

• 保留证据：务必保留好与事故相关的所有证据，包括现场照片、视频、证人证言、医疗记录等。这些证据在后续沟通、复核或诉讼中都将发挥重要作用。
• 了解保险条款：熟悉自身及对方车辆的保险条款，特别是关于事故赔偿、免责等方面的规定。这有助于在沟通或诉讼中更好地维护自身权益。
• 寻求专业帮助：若对法律程序或保险条款不熟悉，可寻求专业律师或保险顾问的帮助。他们能提供更具体、专业的建议和指导。

在处理此类问题时，务必保持冷静、理性，通过合法途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。