企业财产分配出现严重不公且法人涉及侵占行为时，相关协议有可能被认定为无效，但具体需结合实际情况和法律规定进行判断。以下从不同角度进行分析：
一、协议无效的法律依据
《民法典》相关规定：
- 根据《民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。若企业财产分配协议存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形，损害国家、集体或第三人利益，或违反法律、行政法规的强制性规定，该协议可能被认定为无效。
- 特别地，若法人利用职务便利，侵占企业财产，并以此为基础签订财产分配协议，该协议可能因法人缺乏真实意思表示或存在恶意串通等情形而被认定为无效。
《公司法》相关规定：
- 根据《公司法》第二十一条，公司的控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员不得利用其关联关系损害公司利益。违反前款规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。若法人作为上述人员，利用关联关系侵占公司财产，并签订财产分配协议，该协议可能因违反公司法规定而被认定为无效。
二、协议无效的具体情形
法人侵占企业财产：
- 若法人通过虚构债务、隐瞒资产、转移财产等手段，侵占企业财产，并以此为基础签订财产分配协议，该协议可能因法人缺乏真实意思表示或存在欺诈行为而被认定为无效。
- 例如，法人虚构一笔债务，将企业资产转移至个人名下，并与其他股东签订财产分配协议，将虚构债务作为分配依据。此时，该协议可能因法人欺诈行为而被认定为无效。
协议内容显失公平：
- 若企业财产分配协议内容显失公平，如一方获得远超过其应得份额的财产，而另一方则获得极少或没有获得财产，该协议可能因违反公平原则而被认定为无效或可撤销。
- 例如，在企业破产清算过程中，法人利用职务便利，与其他股东签订财产分配协议，将大部分财产分配给自己，而留给其他股东极少财产。此时，该协议可能因显失公平而被认定为无效或可撤销。
三、法律建议
收集证据：
- 若企业认为财产分配协议存在无效情形，应首先收集相关证据，如财务记录、交易凭证、协议文本、证人证言等，以证明协议存在欺诈、胁迫、恶意串通或显失公平等情形。
寻求法律救济：
- 企业可以依据收集到的证据，向法院提起诉讼，请求确认财产分配协议无效或撤销该协议。法院将根据事实和法律规定，对协议的效力进行判断，并作出相应裁决。
加强内部管理：
- 为避免类似情况再次发生，企业应加强内部管理，完善财务制度和监督机制，确保法人和其他管理人员不得利用职务便利侵占企业财产或签订不公平的财产分配协议。
若您遇到企业财产分配协议无效的相关问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。