若单位签订了违法合同，您有权采取以下措施维护自身权益：

1. 明确违法情形，判断合同效力
   首先需确认合同违法性具体表现。根据《民法典》第153条，违反法律、行政法规强制性规定的合同无效；若仅部分条款违法，其他条款仍可能有效。例如：

   • 合同内容涉及非法交易（如走私、贩毒等），则合同整体无效；
     
   • 若仅约定“员工自愿放弃社保”，该条款因违反《社会保险法》而无效，但合同其他条款（如工作内容、薪资）仍可能有效。
     建议：收集合同文本、沟通记录等证据，明确违法点，为后续维权提供依据。

2. 与单位协商，要求修正或解除合同
   若单位因疏忽导致合同违法（如未办理审批手续），可先尝试协商：

   • 要求单位修改违法条款（如补充审批手续、调整薪资结构等）；
     
   • 若合同已无法履行（如项目违法被叫停），可协商解除合同，并要求单位赔偿损失（如已投入的劳动成本）。
     注意：协商过程建议书面化（如邮件、微信记录），避免口头约定。

3. 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁
   若单位拒绝协商或存在恶意违法（如克扣工资、强迫劳动），可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁：

   • 投诉：向当地劳动保障监察大队举报，要求单位整改并赔偿损失（如补发工资、补缴社保）；
     
   • 仲裁：若争议无法通过投诉解决，可申请劳动仲裁，主张合同无效或部分无效，并要求单位承担违法责任（如支付经济补偿金、赔偿金）。
     证据清单：劳动合同、工资条、考勤记录、沟通记录、违法事实证明（如项目批文、行政处罚决定书等）。

4. 向法院起诉，主张合同无效或赔偿
   若劳动仲裁未达预期，或争议涉及非劳动领域（如单位与外部合作方签订违法合同），可直接向法院起诉：

   • 确认合同无效：依据《民法典》第154条，主张单位与第三方恶意串通损害您权益，要求法院宣告合同无效；
     
   • 赔偿损失：若因合同违法导致您遭受损失（如因单位违法经营被牵连罚款），可要求单位赔偿。
     流程提示：起诉需提交起诉状、证据材料，并缴纳诉讼费，建议提前咨询律师准备材料。

5. 特殊情形：单位涉嫌犯罪的应对
   若单位通过违法合同实施犯罪（如诈骗、非法集资），您可能面临连带风险：

   • 立即离职：避免被认定为共犯；
     
   • 举报犯罪：向公安机关报案，提供线索协助调查；
     
   • 申请证人保护：若担心报复，可向公安机关申请保护措施。
     法律后果：单位可能被追究刑事责任，您若未参与犯罪，一般无需承担刑事责任，但需配合调查。

行动建议：

• 优先通过协商、投诉解决，成本低、效率高；
  
• 若争议复杂或金额较大，建议委托律师介入，制定针对性策略；
  
• 保留所有证据原件，避免单位销毁或篡改。
  

如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供详细方案。