结论：农民工早上起床去厕所死在厕所里，是否算工伤不能一概而论，需要结合具体情况来判断。

分析如下：

1. 工伤认定的一般原则：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定主要遵循“三工”原则，即工作时间、工作场所、工作原因。若死亡发生在工作时间和工作场所内，且与工作有直接关联，则通常会被认定为工伤。

2. 具体到本案例的情况：

   • 若死亡发生在工作时间前，且与工作无直接关联：例如，农民工在早上起床后，准备上班前去厕所，此时若发生意外死亡，且该死亡与工作无直接关联（如因个人疾病突发等），则通常不会被认定为工伤。
   • 若死亡虽发生在工作时间前，但与工作有间接关联：这种情况较为复杂，需要具体分析。例如，若农民工因工作原因（如加班、夜班等）导致睡眠不足，进而在早上起床去厕所时发生意外，此时是否认定为工伤可能存在争议。这需要根据具体证据和法律规定来判断。
   • 若存在特殊情况：如农民工在工地宿舍内起床去厕所，且该宿舍被视为工作场所的延伸（如工地提供的集体宿舍，且宿舍管理规定与工作相关），此时若发生意外死亡，且与工作有一定关联，也有可能被认定为工伤。但这同样需要具体证据和法律规定的支持。

3. 法律建议：

   • 及时报案：若发生此类事件，应立即向当地劳动保障部门报案，并申请工伤认定。
   • 收集证据：收集与死亡事件相关的所有证据，包括现场照片、医疗记录、证人证言等，以便在工伤认定过程中提供有力支持。
   • 咨询专业律师：由于工伤认定涉及复杂的法律问题和证据收集，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。

可能涉及的法律后果：

• 若被认定为工伤，农民工的家属将有权获得相应的工伤保险待遇，包括丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金等。
• 若未被认定为工伤，则农民工的家属可能无法获得工伤保险待遇，但可能仍有权通过其他途径（如民事诉讼）寻求赔偿。

总结：农民工早上起床去厕所死在厕所里是否算工伤，需要结合具体情况来判断。在处理此类事件时，建议及时报案、收集证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。