年休假不申请就作废的做法是不合法的，用人单位应尊重劳动者的年休假权利，合理安排或给予相应补偿。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据
《职工带薪年休假条例》第五条：
- 单位应根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。
- 年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。但单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。
- 若单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假，但对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
《企业职工带薪年休假实施办法》第九条和第十条：
- 用人单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排年休假。若确因工作需要不能安排职工年休假或者跨1个年度安排年休假的，应征得职工本人同意。
- 若用人单位经职工同意不安排年休假或者安排职工休假天数少于应休年休假天数的，应当在本年度内对职工应休未休年休假天数，按照其日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。
- 只有在职工因本人原因且书面提出不休年休假的情况下，用人单位才可以只支付其正常工作期间的工资收入。
合法性分析
“年假不休过期作废”的违法性：
- 这一规定违反了法律关于年假安排的灵活性，损害了职工享受带薪年假的权利。
- 它实质上是将劳动者消极的默示行为视为放弃年休假权利的意思表示，这与相关法律规定不符。只有在劳动者以积极的明示方式表示不休年休假时，才能判定其放弃了年休假权利。
用人单位的责任与义务：
- 用人单位不能随意规定年假不休就过期作废，而应尊重劳动者的合法权益。
- 如果用人单位因工作需要改变工作时间或跨年度安排年休假，必须征得职工本人的同意，并确保不违反相关法律法规。
特殊情况说明
用人单位已安排年休假：
- 若用人单位已合理安排年休假，但劳动者因个人原因未休且未提出异议，此时过期不休作废的做法在一定条件下可能被视为合法且合理。但这种情况并不常见，且需要具体分析。
经济补偿：
- 若用人单位因工作需要不能安排年休假或安排天数不足，应依法支付未休年休假工资报酬，以确保劳动者的合法权益得到保障。
劳动者权益保护
- 劳动者发现自己的年假权利受到侵害时，有权向劳动监察部门投诉或通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，年休假不申请就作废的做法是不合法的。用人单位应严格遵守相关法律法规，合理安排职工的年休假，确保劳动者的合法权益不受侵害。同时，劳动者也应了解自己的权利，积极维护自身的合法权益。如果您在年休假方面遇到任何问题，可以直接向我咨询。