被告人在审查起诉阶段的供述，在当庭翻供的情况下，其能否被采用，需结合具体情况综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、翻供原因的合理性
非法取证影响：若被告人提出翻供是因为庭前供述系非法取得（如刑讯逼供、威胁、引诱等），法庭将启动对证据收集合法性的调查程序。若查证属实，庭前供述将被排除，不得作为定案依据。此时，若当庭供述有其他证据印证，则可能被采信。
记忆错误或误解：若被告人因记忆错误或对法律条款理解有误而翻供，且当庭供述与其他证据相符，法庭将综合评估其真实性，并可能采信当庭供述。
无合理理由翻供：若被告人无正当理由随意翻供，且庭前供述与其他证据相互印证，法庭将倾向于采信庭前供述。此时，翻供行为可能影响被告人的信誉和可信度，在最终判决时予以考量。
二、证据的综合审查
证据链条的完整性：法庭会将被告人的翻供内容与全案其他证据进行综合比对，以评估翻供的真实性和可信度。若翻供导致案件事实存疑，无法形成完整证据链条，法庭将依据“疑罪从无”原则作出无罪判决。
新证据的调取：根据案件需要，法庭可以决定补充调取新的证据，或对被告人提及的新证人、证据线索进行调查核实。若新证据支持当庭供述，法庭将重新审查全案证据，并可能采信当庭供述。
三、法律原则的适用
“疑罪从无”原则：若翻供导致案件事实不清、证据不足，无法排除合理怀疑，法庭将依据“疑罪从无”原则作出无罪判决。这是刑事诉讼中的重要原则，旨在保障被告人的合法权益。
“证据确实、充分”标准：根据《刑事诉讼法》的相关规定，定罪量刑的事实都有证据证明，且据以定案的证据均经法定程序查证属实，综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。若翻供后的证据无法达到这一标准，法庭将倾向于采信庭前供述（若其与其他证据相符）。
四、实际操作中的考量
法庭讯问与询问：审判人员将对被告人进行详细讯问，引导其如实陈述案件事实。同时，公诉人和辩护人有权经审判长许可对被告人进行询问，以揭示翻供的不合理之处或支持翻供内容。这一过程有助于法庭全面了解翻供的具体情况和原因。
判决时的综合考量：法庭在最终判决时，将综合考虑被告人的翻供行为、庭前供述的真实性、其他证据的印证情况以及法律原则的适用等因素。若翻供行为无正当理由且影响案件事实认定，法庭可能对其作出不利评价。
举例说明：
假设被告人在审查起诉阶段如实供述了犯罪事实，但在庭审中突然翻供称自己未实施犯罪行为。若法庭调查发现其翻供系因受到刑讯逼供等非法手段影响，且当庭供述有其他证据（如监控录像、证人证言等）印证其未实施犯罪行为，则法庭将采信当庭供述并作出无罪判决。
反之，若被告人无正当理由随意翻供，且庭前供述与其他证据（如物证、书证、证人证言等）相互印证，则法庭将倾向于采信庭前供述并据此定罪量刑。
总结与建议：
被告人在审查起诉阶段的供述在当庭翻供的情况下能否被采用，需结合翻供原因的合理性、证据的综合审查以及法律原则的适用等因素进行综合判断。作为被告人，应如实陈述案件事实，避免不必要的翻供行为对案件审理造成不良影响。若您或您身边的人遇到类似法律问题，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议。