结论：入职新单位后，原单位作出的自动离职处理，一般情况下不会直接导致工龄清零，但具体是否影响工龄计算，需结合原单位性质、自动离职原因及新单位工龄认定政策综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、工龄计算的基本原则

工龄通常指劳动者以工资收入为生活资料的全部或主要来源的工作时间，分为连续工龄和本单位工龄。连续工龄影响劳动者享受带薪年休假、医疗期、经济补偿金等权益，其计算一般遵循“连续计算”原则，即劳动者在同一或不同用人单位工作期间，只要未出现法定中断情形（如被追究刑事责任、自动离职后未再就业等），工龄应连续计算。

二、原单位自动离职对工龄的影响

1. 若原单位为国有企业或事业单位：
   根据《劳动部办公厅对〈关于贯彻〈外商投资企业劳动管理规定〉有关问题的复函〉中有关终止合同经济补偿问题的复函》（劳办发〔1996〕33号）及部分地方规定，劳动者因自动离职（未经单位批准擅自离职）被原单位除名的，其连续工龄可能从重新就业之日起重新计算。但需注意：

   • 例外情形：若劳动者离职后未再就业，或新单位认可其原工龄（如通过档案转移、社保缴纳记录等证明），则工龄可能连续计算。
     
   • 地方差异：部分地区（如上海）规定，自动离职被除名后，若劳动者在6个月内重新就业，原工龄可连续计算；超过6个月则重新计算。

2. 若原单位为民营企业或外资企业：
   民营企业、外资企业一般无“除名”制度，自动离职通常视为劳动者单方解除劳动合同。根据《劳动合同法》及相关司法解释，劳动者离职后，原单位工龄是否清零取决于新单位的认定：

   • 新单位认可原工龄：若新单位在入职时通过档案、社保记录等认可劳动者原工龄，则工龄连续计算。
     
   • 新单位不认可原工龄：若新单位明确要求从入职之日起计算工龄（如未转移档案或社保），则原工龄可能不纳入新单位工龄计算，但不影响劳动者整体连续工龄（可通过社保缴纳记录证明）。

三、劳动者如何维护工龄权益？

1. 保留证据：

   • 保存原单位劳动合同、工资记录、社保缴纳证明、离职证明等材料，以证明工作经历。
     
   • 若原单位出具“自动离职”或“除名”文件，需核实其是否符合法定程序（如是否提前通知、是否听取劳动者申辩等），若程序违法，可主张文件无效。

2. 与新单位沟通：

   • 入职时明确询问新单位工龄认定政策，要求将原工龄纳入计算（尤其涉及带薪年休假、经济补偿金等权益时）。
     
   • 若新单位拒绝，可要求其出具书面说明，并保留协商记录。

3. 法律途径：

   • 若因工龄问题与新单位发生争议，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张连续工龄权益。
     
   • 仲裁时需提供原单位工作证明、社保记录、新单位入职材料等证据。

四、特殊情形提示

• 社保缴纳连续性：即使原单位工龄因自动离职被清零，只要社保未中断缴纳，社保缴费年限仍连续计算，不影响退休养老金等权益。
  
• 经济补偿金计算：若因原单位违法解除劳动合同导致工龄中断，劳动者可依据《劳动合同法》主张赔偿金（按经济补偿标准的2倍计算）。

建议：工龄问题涉及劳动者核心权益，若原单位已作出自动离职处理，建议尽快核实档案转移、社保缴纳情况，并与新单位明确工龄认定政策。如有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供专业建议。