员工是否有权拒绝到传染病医院上班，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、员工担忧的合理性及法律依据
员工担忧的合理性：
- 如果员工担心到传染病医院上班会感染疾病，这种担忧在特定情况下是合理的，尤其是当传染病医院正在处理高传染性的疾病时。然而，这种担忧并不构成无条件的拒绝上班权利。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》，员工有义务遵守用人单位的合理工作安排，除非该安排违反法律法规或存在危及员工生命健康安全的情形。
- 同时，根据《中华人民共和国传染病防治法》，传染病医院有义务采取必要的防护措施，保护医护人员和患者的安全。如果医院已经采取了充分的防护措施，员工拒绝上班可能缺乏法律依据。
二、不同情况下的处理方式
医院未采取充分防护措施：
- 如果传染病医院未能提供必要的防护措施，如口罩、防护服、消毒设备等，导致员工面临感染风险，员工有权拒绝上班，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
- 在此情况下，员工还可以依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，以医院未提供劳动安全卫生条件为由，提出解除劳动合同，并要求医院支付经济补偿。
医院已采取充分防护措施：
- 如果传染病医院已经采取了充分的防护措施，并确保了工作环境的卫生安全，员工拒绝上班可能构成旷工行为。
- 在此情况下，医院有权依据内部规章制度对员工进行处理，如警告、扣除薪资等。如果员工连续旷工达到一定天数（如连续旷工超过十五天，或一年内累计旷工超过三十天），医院还有权依法解除劳动合同。
员工属于高感染风险人群：
- 如果员工属于高感染风险人群，如患有基础疾病、孕妇等，且医院无法提供适合其健康状况的工作安排，员工可以与医院协商调整工作岗位或工作时间。
- 如果协商无果，且员工确实无法胜任原工作，医院可以考虑安排员工待岗，并按当地规定支付待岗生活费。但这一安排需双方协商一致，并签订相关协议。
三、建议与措施
员工方面：
- 在拒绝上班前，员工应充分了解医院的防护措施和自身健康状况，评估感染风险的真实性。
- 如果员工认为医院未提供必要的防护措施，可以与医院沟通协商，要求改善工作条件。
- 如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
医院方面：
- 医院应确保提供充分的防护措施，保障员工的生命健康安全。
- 在处理员工拒绝上班的情况时，医院应遵循法律法规和内部规章制度，确保处理结果合法合规。
- 医院还应加强与员工的沟通协商，了解员工的担忧和需求，共同寻找解决方案。
总结来说，员工是否有权拒绝到传染病医院上班取决于医院是否提供了充分的防护措施以及员工的具体情况。在处理此类问题时，双方应保持沟通协商，遵循法律法规和内部规章制度，共同维护劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。