结论前置：法院的判决会因具体案件情况而有所不同，但总体上会围绕建设用地许可证和土地使用证的法律性质、效力以及案件具体事实来综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若案件涉及土地权属争议：

   • 建设用地许可证通常是土地使用者依法取得建设用地使用权的法律凭证之一，但它并不等同于土地使用证。土地使用证是确认土地使用权的法律文件，具有更高的法律效力。
   • 在土地权属争议中，如果仅有建设用地许可证而无土地使用证，法院可能会认为土地使用权尚未得到最终确认，从而要求当事人先通过行政程序（如申请土地登记、补办土地使用证等）来明确土地权属。
   • 如果争议双方均无法提供充分的证据证明自己对土地享有合法使用权，法院可能会根据公平、合理原则，结合案件实际情况，作出相应的判决或调解。

2. 若案件涉及土地使用权转让、抵押等法律行为：

   • 在进行土地使用权转让、抵押等法律行为时，通常需要提供土地使用证作为权属证明。如果仅有建设用地许可证而无土地使用证，这些法律行为可能会因权属不明而面临法律障碍。
   • 法院在审理此类案件时，会重点审查土地使用权的合法性、有效性以及转让、抵押等行为的合法性。如果因缺乏土地使用证而导致行为无效或存在瑕疵，法院可能会判决相关行为无效或要求当事人承担相应的法律责任。

3. 若案件涉及行政处罚或行政诉讼：

   • 如果因未取得土地使用证而违反土地管理法律法规，受到行政处罚，当事人对行政处罚决定不服提起行政诉讼的，法院会审查行政处罚决定的合法性、合理性以及程序正当性。
   • 在此过程中，建设用地许可证可能会作为证据之一被法院审查，但单独的建设用地许可证并不足以证明土地使用权的合法性。如果法院认为行政处罚决定合法、合理且程序正当，可能会维持行政处罚决定；如果认为存在违法或不当之处，则可能会撤销或变更行政处罚决定。

建议：在实际操作中，如果仅有建设用地许可证而无土地使用证，建议当事人尽快通过合法途径补办土地使用证，以明确土地权属，避免法律风险。同时，在涉及土地相关法律行为时，务必确保所有法律文件齐全、合法有效，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。