针对您提出的问题，即孩子与爸爸没有血缘关系但与妈妈有血缘关系时如何办理出生证明，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，出生证明（即《出生医学证明》）是证明婴儿出生状态、血亲关系以及申报国籍、户籍、取得公民身份号码的法定医学证明。在常规情况下，出生证明上会同时记录父母双方的信息。然而，在您所描述的特殊情况下，即孩子与爸爸没有血缘关系但与妈妈有，我们需要根据具体情况来处理。

一、如果孩子是在婚姻关系存续期间出生

1. 若母亲希望孩子随父入户：

   • 尽管孩子与父亲没有血缘关系，但如果母亲希望孩子随父入户，且父亲愿意承担抚养责任，那么理论上可以通过法律程序（如收养或确认抚养关系）来建立法律上的父子关系。但这一过程可能涉及复杂的法律程序，且需要父亲同意。
   • 在实际操作中，更常见的是母亲选择让孩子随自己入户，此时只需提供母亲的居民户口簿、居民身份证以及出生医学证明（若已办理）即可。若出生医学证明上只有母亲信息，也可直接凭此证明和母亲的相关证件办理入户。

2. 若母亲希望孩子随母入户：

   • 这是最直接且常见的情况。母亲只需提供自己的居民户口簿、居民身份证以及出生医学证明（若已办理，且证明上母亲信息齐全）即可为孩子办理入户。

二、如果孩子是在非婚姻关系期间出生

1. 随母入户：

   • 母亲需提供非婚生育说明、出生医学证明（若已办理且母亲信息齐全）、自己的居民户口簿和居民身份证，即可为孩子办理随母入户。

2. 随父入户（若父亲愿意承担抚养责任）：

   • 这种情况下，由于孩子与父亲没有血缘关系，因此需要额外的法律文件来证明父子关系。这通常包括经省司法厅审核登记的司法鉴定机构和司法鉴定人出具的亲子鉴定证明（但此处实际应为确认抚养关系的法律文件，因为亲子鉴定无法证明非血缘关系的父子关系），或者通过法律程序（如收养）来建立法律上的父子关系。
   • 实际操作中，由于非血缘关系的父子关系在法律上较为复杂，因此更建议母亲选择让孩子随自己入户。

三、关于出生医学证明的办理

• 如果孩子已经出生但尚未办理出生医学证明，母亲应尽快联系孩子出生的医疗机构或当地卫生行政部门，按照相关规定申请补发或办理出生医学证明。
• 办理出生医学证明时，通常需要提供父母的身份证、结婚证（如适用）以及孩子的出生记录等相关材料。但在您所描述的情况下，若父亲与孩子无血缘关系，则可能只需提供母亲的相关证件和孩子的出生记录。

四、特殊情况下的处理建议

• 如果母亲在办理过程中遇到任何困难或疑问，建议咨询当地公安派出所或户籍管理部门，他们可以根据具体情况提供更详细的指导和帮助。
• 如果涉及法律程序（如收养或确认抚养关系），建议母亲寻求专业律师的协助，以确保整个过程的合法性和有效性。

综上所述，孩子与爸爸没有血缘关系但与妈妈有血缘关系时，办理出生证明和入户的主要依据是母亲的证件和出生医学证明。在特殊情况下，可能需要额外的法律文件或程序来建立法律上的父子关系或确认抚养关系。希望这些信息能对您有所帮助。