结论前置：在合伙纠纷中，原告可以申请司法鉴定以明确赔偿，法院会根据鉴定结果、案件事实及法律规定来认定赔偿。

一、原告申请司法鉴定的可能性与程序

在合伙纠纷中，当原被告双方就赔偿金额存在争议，且该争议涉及专业性问题（如财产损失评估、业务损失计算等）时，原告有权向法院申请司法鉴定。司法鉴定是一种通过专业机构或专家对特定事项进行科学、客观、公正的评估和判断的活动，其结果往往作为法院认定事实的重要依据。

申请司法鉴定的程序通常包括以下几个步骤：

1. 提交申请：原告需在诉讼过程中，向法院提交书面鉴定申请，明确鉴定事项、鉴定目的及鉴定材料等。
2. 法院审查：法院会对原告的鉴定申请进行审查，判断其是否符合鉴定条件，如鉴定事项是否属于法院委托鉴定范围、鉴定材料是否充分等。
3. 选定鉴定机构：经法院审查同意后，双方当事人可以协商选定鉴定机构；协商不成的，由法院指定。
4. 进行鉴定：鉴定机构按照法定程序进行鉴定，并出具鉴定意见书。
5. 质证与认证：鉴定意见书需经双方当事人质证，法院结合其他证据进行综合认证，以确定其证明力。

二、法院对鉴定结果的认定

法院在认定赔偿时，会综合考虑鉴定结果、案件事实及法律规定。具体来说：

1. 鉴定结果的合法性：法院会审查鉴定机构的资质、鉴定程序的合法性以及鉴定意见书的规范性等，确保鉴定结果具有法律效力。
2. 鉴定结果与案件事实的关联性：法院会分析鉴定结果是否与案件事实存在直接关联，能否作为认定赔偿的依据。例如，在财产损失评估中，鉴定结果需与原告主张的损失范围、损失程度等相吻合。
3. 法律规定与赔偿原则：法院在认定赔偿时，还会遵循相关法律规定和赔偿原则，如过错责任原则、公平责任原则等。根据这些原则，法院会确定被告应承担的赔偿责任范围及赔偿金额。

三、特殊情况下的处理

1. 鉴定结果存在争议：如果双方当事人对鉴定结果存在争议，法院可能会要求鉴定机构进行补充鉴定或重新鉴定，以确保鉴定结果的准确性和公正性。
2. 鉴定结果与案件事实不符：如果鉴定结果与案件事实明显不符，或者存在其他足以影响鉴定结果公正性的情形，法院可能会不予采信该鉴定结果，并依据其他证据进行认定。

四、法律建议

对于原告而言，在申请司法鉴定前，应充分准备相关证据材料，明确鉴定事项和目的，以确保鉴定结果的准确性和有效性。同时，在诉讼过程中，应积极配合法院和鉴定机构的工作，及时提供必要的协助和配合。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。