结论：建设单位是否可以要求返还已支付的工程预付款，需根据具体情况判断，主要涉及诉讼时效、合同效力及双方过错等因素。以下从不同角度进行分析：

一、诉讼时效角度

1. 一般诉讼时效规定

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 在本案例中，建设单位已支付工程预付款但施工单位未施工，若建设单位在支付预付款时即知道或应当知道施工单位可能不履行合同，则诉讼时效自支付之日起计算；若建设单位在支付后一段时间才发现施工单位不施工，则诉讼时效自发现之日起计算。

2. 诉讼时效已过的情况

   • 若自建设单位知道或应当知道施工单位不施工之日起已超过三年，且在此期间未发生诉讼时效中断、中止等情形，则建设单位要求返还预付款的请求可能因超过诉讼时效而得不到法院支持。

3. 诉讼时效未过的情况

   • 若自建设单位知道或应当知道施工单位不施工之日起未超过三年，或虽超过三年但存在诉讼时效中断、中止等情形，则建设单位仍有权要求施工单位返还预付款。

二、合同效力及双方过错角度

1. 合同无效或可撤销的情况

   • 若建设单位与施工单位签订的合同存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、恶意串通等），则建设单位有权要求施工单位返还预付款，且不受诉讼时效的限制（但需注意，因合同无效或可撤销而产生的返还请求权，仍可能受到其他时效规定的限制，如除斥期间等）。

2. 合同有效但施工单位违约的情况

   • 若合同有效，但施工单位未按约定施工，构成违约，则建设单位有权要求施工单位承担违约责任，包括返还预付款、赔偿损失等。此时，建设单位要求返还预付款的请求受诉讼时效的限制。

3. 双方均有过错的情况

   • 若双方在合同签订或履行过程中均存在过错，如建设单位未按时提供施工条件、施工单位未按时施工等，则可能根据双方的过错程度分担责任。在此情况下，建设单位要求返还预付款的请求可能因双方过错而部分或全部得不到支持。

三、实际操作建议

1. 收集证据

   • 建设单位应收集与施工单位签订的合同、支付预付款的凭证、施工单位未施工的证据等，以证明其主张。

2. 咨询专业律师

   • 由于法律问题复杂多变，且涉及诉讼时效、合同效力、双方过错等多个方面，建议建设单位在采取行动前咨询专业律师，以便更准确地评估风险、制定策略。

3. 考虑和解或调解

   • 在诉讼前，建设单位可以考虑与施工单位进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案，避免不必要的法律纠纷。

总结：建设单位是否可以要求返还已支付的工程预付款，需根据诉讼时效、合同效力及双方过错等因素综合判断。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便更准确地评估风险、制定策略。