员工离职5年后主张劳动关系认定，法院一般会根据双方提供的证据及法律规定，综合判断劳动关系是否成立，若证据不足或超过时效，法院可能不予支持其主张。具体分析如下：

1. 劳动关系认定的基本原则
   根据《劳动法》及《劳动合同法》相关规定，劳动关系的认定需满足三个核心要件：主体资格（劳动者与用人单位符合法定条件）、从属性（劳动者接受用人单位管理，从事用人单位安排的工作）、劳动报酬支付（用人单位向劳动者支付劳动报酬）。若离职后双方已无实际用工关系，且未继续履行劳动权利义务，法院通常不会认定劳动关系存续。

2. 诉讼时效的影响
   若员工主张的是劳动报酬、经济补偿等债权请求权，需受《劳动争议调解仲裁法》第27条“1年仲裁时效”限制（自知道或应当知道权利被侵害之日起计算）。离职5年后主张，若未在时效内申请仲裁或提起诉讼，且无法证明存在时效中断、中止情形，法院可能以“超过时效”为由驳回诉求。
   例外情形：若主张的是确认劳动关系本身（非债权请求），部分法院认为不受1年时效限制，但需结合地方司法实践判断。

3. 证据的证明力
   员工需提供充分证据证明劳动关系存续，例如：

   • 劳动合同、工资发放记录、社保缴纳证明；
     
   • 工作证、考勤记录、工作邮件、微信聊天记录等；
     
   • 同事证言、用人单位承认劳动关系的书面材料。
     若离职后双方已无任何联系，且员工无法提供有效证据，法院可能认定劳动关系已终止。

4. 特殊情形处理

   • 未签订书面劳动合同：若员工能证明实际用工关系（如上述证据），法院可能依据《劳动合同法》第7条“事实劳动关系”认定劳动关系成立，但需在离职后1年内主张权利（如未签合同双倍工资差额）。
     
   • 离职后继续提供劳务：若双方形成劳务关系（非劳动关系），则不受劳动法调整，法院可能按民事合同纠纷处理。
     
   • 用人单位未办理离职手续：若员工能证明用人单位未依法出具离职证明、未停缴社保等，可能主张用人单位承担赔偿责任，但需在时效内提出。

建议：若您面临此类纠纷，需尽快收集证据（如工资流水、工作记录等），并注意诉讼时效问题。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细分析。