结论：在此情境下，司机很可能构成交通肇事罪，但具体是否构成还需结合事故的具体情况、责任认定、因果关系及法律法规等多方面因素进行综合判断。
法律责任分析：
责任认定与入罪标准：
- 根据相关法律法规，若肇事者在交通事故中负主要或全部责任，并造成一人死亡，通常构成交通肇事罪。您提到司机负主要责任，且受害者住院三个月后死亡，这符合交通肇事罪在责任认定方面的基本要求。
- 交通肇事罪的构成还要求肇事者违反交通运输管理法规，如超速、酒驾、闯红灯等，并发生重大事故，致人重伤、死亡或使公私财产遭受重大损失。若司机存在上述违规行为，且其违规行为与受害者的死亡之间存在直接因果关系，则更可能构成交通肇事罪。
因果关系：
- 肇事行为与死亡结果之间必须存在直接的因果关系。在您描述的情况下，虽然受害者住院三个月后死亡，但只要能够证明死亡结果是由交通事故直接导致的，或者交通事故是导致死亡的主要原因，那么司机就可能因交通肇事罪被追究刑事责任。
- 如有证据表明受害者的死亡并非完全由交通事故直接导致，如医院治疗失误、受害者自身疾病等，则可能影响对司机的责任认定。但这种情况需要具体证据支持，且通常不会完全免除司机的刑事责任，只是可能减轻其责任程度。
主观过错：
- 交通肇事罪是过失犯罪，要求肇事者主观上存在过失。即司机因疏忽大意或过于自信而导致事故发生，而非故意为之。若能够证明司机存在故意行为，如故意撞人等，则可能构成更严重的犯罪，如故意杀人罪或故意伤害罪。
实际操作建议：
- 及时报警与配合调查：事故发生后，司机应第一时间报警并配合交警部门的调查工作。这是认定事故责任、确定是否构成犯罪的重要步骤。
- 保留证据与咨询专业意见：司机应保留好相关证据材料，如事故现场照片、医疗记录、证人证言等，并咨询专业律师以获取针对性的法律意见。律师可以根据具体情况分析司机的法律责任，并提供相应的法律建议。
- 加强交通安全意识：无论是否构成犯罪，司机都应加强交通安全意识，遵守交通规则，共同维护道路交通的安全与秩序。这不仅是法律的要求，也是对自己和他人生命安全的负责。
可能法律后果：
- 若司机构成交通肇事罪，将可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役等。具体刑罚将根据事故的严重程度、司机的责任程度以及是否存在其他恶劣情节等因素综合确定。
- 除了刑事责任外，司机还可能需承担民事赔偿责任，包括赔偿受害者的医疗费、丧葬费、死亡赔偿金等费用。
综上所述，司机是否构成交通肇事罪需结合事故的具体情况、责任认定、因果关系及法律法规等多方面因素进行综合判断。若您或他人遇到类似情况，建议及时向我咨询以获取专业的法律帮助。