公司私自扣税一般是不合法的，具体是否合法及可能面临的处罚，需根据具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、公司私自扣税的合法性分析
合法扣税的情形：
- 公司作为扣缴义务人，按照税法规定，如个人所得税法、企业所得税法等，代扣代缴员工的个人所得税或企业的应纳税款，这是合法的。这种情况下，公司扣税是基于法律授权，且扣税的金额、方式等均需严格遵循税法规定。
非法扣税的情形：
- 如果公司未经员工同意，擅自扣除员工工资中的税款以外的其他费用，或者以扣税为名，实际扣除的是非税款项，这可能构成非法扣税。例如，公司以“扣税”为由，扣除员工的奖金、补贴等，而实际上这些款项并不属于应税范围，或者公司并未按照税法规定的税率和计算方法进行扣税。
二、公司私自扣税可能面临的处罚
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十九条：“扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上三倍以下的罚款。” 如果公司私自扣税，且未按照税法规定将扣缴的税款上缴税务机关，税务机关有权对公司进行处罚。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果公司私自扣税的行为构成犯罪，如逃税罪等，公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，逃税数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
三、员工应对公司私自扣税的建议
核实扣税情况：
- 员工应首先核实公司扣税的具体情况，包括扣税的金额、方式、依据等。如果发现公司扣税存在异常，如扣税金额过高、扣税项目不明确等，应及时与公司沟通，要求公司提供合理的解释和证明。
向税务机关举报：
- 如果公司无法提供合理的解释和证明，或者员工认为公司存在非法扣税的行为，可以向当地税务机关举报。税务机关将依法进行调查处理，并保护举报人的合法权益。
寻求法律援助：
- 如果员工因公司私自扣税而遭受损失，如工资被非法扣除、奖金被取消等，可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，公司私自扣税一般是不合法的，可能面临行政处罚甚至刑事责任。员工应核实扣税情况，必要时向税务机关举报或寻求法律援助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。